Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE0

Rnf138, E3 ubiquitin-protein ligase RNF138, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138Q9CQE0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf138Q9CQE0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf138Q9CQE0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf138Q9CQE0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf138Q9CQE0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf138Q9CQE0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf138Q9CQE0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf138Q9CQE0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf138Q9CQE0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf138Q9CQE0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rnf138Q9CQE0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rnf138Q9CQE0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf138Q9CQE0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf138Q9CQE0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf138Q9CQE0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf138Q9CQE0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf138Q9CQE0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rnf138Q9CQE0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rnf138Q9CQE0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnf138Q9CQE0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnf138Q9CQE0 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf138Q9CQE0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf138Q9CQE0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf138Q9CQE0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf138Q9CQE0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf138Q9CQE0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf138Q9CQE0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf138Q9CQE0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf138Q9CQE0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf138Q9CQE0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf138Q9CQE0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf138Q9CQE0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf138Q9CQE0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf138Q9CQE0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf138Q9CQE0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf138Q9CQE0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf138Q9CQE0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf138Q9CQE0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf138Q9CQE0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf138Q9CQE0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf138Q9CQE0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf138Q9CQE0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf138Q9CQE0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf138Q9CQE0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf138Q9CQE0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf138Q9CQE0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf138Q9CQE0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf138Q9CQE0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf138Q9CQE0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf138Q9CQE0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf138Q9CQE0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf138Q9CQE0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf138Q9CQE0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf138Q9CQE0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf138Q9CQE0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf138Q9CQE0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf138Q9CQE0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf138Q9CQE0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf138Q9CQE0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf138Q9CQE0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf138Q9CQE0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf138Q9CQE0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf138Q9CQE0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf138Q9CQE0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf138Q9CQE0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf138Q9CQE0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf138Q9CQE0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf138Q9CQE0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf138Q9CQE0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf138Q9CQE0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf138Q9CQE0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf138Q9CQE0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf138Q9CQE0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf138Q9CQE0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf138Q9CQE0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf138Q9CQE0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf138Q9CQE0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Rnf138Q9CQE0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Rnf138Q9CQE0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf138Q9CQE0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf138Q9CQE0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf138Q9CQE0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf138Q9CQE0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf138Q9CQE0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf138Q9CQE0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf138Q9CQE0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf138Q9CQE0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf138Q9CQE0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf138Q9CQE0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf138Q9CQE0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf138Q9CQE0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf138Q9CQE0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf138Q9CQE0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf138Q9CQE0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf138Q9CQE0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Rnf138Q9CQE0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf138Q9CQE0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf138Q9CQE0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf138Q9CQE0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rnf138Q9CQE0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms