Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPT7

4930519G04Rik, RIKEN cDNA 4930519G04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930519G04RikQ9CPT7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
4930519G04RikQ9CPT7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
4930519G04RikQ9CPT7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
4930519G04RikQ9CPT7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
4930519G04RikQ9CPT7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
4930519G04RikQ9CPT7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
4930519G04RikQ9CPT7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
4930519G04RikQ9CPT7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
4930519G04RikQ9CPT7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
4930519G04RikQ9CPT7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
4930519G04RikQ9CPT7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
4930519G04RikQ9CPT7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
4930519G04RikQ9CPT7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
4930519G04RikQ9CPT7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
4930519G04RikQ9CPT7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4930519G04RikQ9CPT7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
4930519G04RikQ9CPT7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
4930519G04RikQ9CPT7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
4930519G04RikQ9CPT7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
4930519G04RikQ9CPT7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
4930519G04RikQ9CPT7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
4930519G04RikQ9CPT7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
4930519G04RikQ9CPT7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
4930519G04RikQ9CPT7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
4930519G04RikQ9CPT7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
4930519G04RikQ9CPT7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
4930519G04RikQ9CPT7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
4930519G04RikQ9CPT7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4930519G04RikQ9CPT7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4930519G04RikQ9CPT7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4930519G04RikQ9CPT7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4930519G04RikQ9CPT7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
4930519G04RikQ9CPT7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
4930519G04RikQ9CPT7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
4930519G04RikQ9CPT7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
4930519G04RikQ9CPT7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4930519G04RikQ9CPT7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4930519G04RikQ9CPT7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4930519G04RikQ9CPT7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4930519G04RikQ9CPT7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4930519G04RikQ9CPT7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4930519G04RikQ9CPT7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4930519G04RikQ9CPT7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
4930519G04RikQ9CPT7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4930519G04RikQ9CPT7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4930519G04RikQ9CPT7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4930519G04RikQ9CPT7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
4930519G04RikQ9CPT7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
4930519G04RikQ9CPT7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
4930519G04RikQ9CPT7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
4930519G04RikQ9CPT7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4930519G04RikQ9CPT7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4930519G04RikQ9CPT7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4930519G04RikQ9CPT7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4930519G04RikQ9CPT7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4930519G04RikQ9CPT7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4930519G04RikQ9CPT7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4930519G04RikQ9CPT7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
4930519G04RikQ9CPT7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
4930519G04RikQ9CPT7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
4930519G04RikQ9CPT7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
4930519G04RikQ9CPT7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
4930519G04RikQ9CPT7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
4930519G04RikQ9CPT7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
4930519G04RikQ9CPT7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4930519G04RikQ9CPT7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4930519G04RikQ9CPT7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4930519G04RikQ9CPT7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4930519G04RikQ9CPT7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
4930519G04RikQ9CPT7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4930519G04RikQ9CPT7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
4930519G04RikQ9CPT7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
4930519G04RikQ9CPT7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
4930519G04RikQ9CPT7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
4930519G04RikQ9CPT7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
4930519G04RikQ9CPT7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4930519G04RikQ9CPT7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4930519G04RikQ9CPT7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
4930519G04RikQ9CPT7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
4930519G04RikQ9CPT7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
4930519G04RikQ9CPT7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
4930519G04RikQ9CPT7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
4930519G04RikQ9CPT7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
4930519G04RikQ9CPT7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
4930519G04RikQ9CPT7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
4930519G04RikQ9CPT7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
4930519G04RikQ9CPT7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
4930519G04RikQ9CPT7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
4930519G04RikQ9CPT7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
4930519G04RikQ9CPT7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
4930519G04RikQ9CPT7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
4930519G04RikQ9CPT7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
4930519G04RikQ9CPT7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
4930519G04RikQ9CPT7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4930519G04RikQ9CPT7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4930519G04RikQ9CPT7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
4930519G04RikQ9CPT7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
4930519G04RikQ9CPT7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
4930519G04RikQ9CPT7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
4930519G04RikQ9CPT7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms