Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim12aQ99PQ1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim12aQ99PQ1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trim12aQ99PQ1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim12aQ99PQ1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim12aQ99PQ1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim12aQ99PQ1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trim12aQ99PQ1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim12aQ99PQ1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim12aQ99PQ1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trim12aQ99PQ1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim12aQ99PQ1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim12aQ99PQ1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trim12aQ99PQ1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim12aQ99PQ1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trim12aQ99PQ1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim12aQ99PQ1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim12aQ99PQ1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Trim12aQ99PQ1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim12aQ99PQ1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim12aQ99PQ1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trim12aQ99PQ1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim12aQ99PQ1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim12aQ99PQ1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim12aQ99PQ1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Trim12aQ99PQ1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim12aQ99PQ1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Trim12aQ99PQ1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trim12aQ99PQ1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trim12aQ99PQ1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Trim12aQ99PQ1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim12aQ99PQ1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trim12aQ99PQ1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim12aQ99PQ1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trim12aQ99PQ1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim12aQ99PQ1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim12aQ99PQ1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim12aQ99PQ1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim12aQ99PQ1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim12aQ99PQ1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim12aQ99PQ1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim12aQ99PQ1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim12aQ99PQ1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim12aQ99PQ1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim12aQ99PQ1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim12aQ99PQ1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim12aQ99PQ1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim12aQ99PQ1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim12aQ99PQ1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim12aQ99PQ1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim12aQ99PQ1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim12aQ99PQ1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim12aQ99PQ1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim12aQ99PQ1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim12aQ99PQ1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim12aQ99PQ1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim12aQ99PQ1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim12aQ99PQ1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim12aQ99PQ1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim12aQ99PQ1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim12aQ99PQ1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim12aQ99PQ1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim12aQ99PQ1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim12aQ99PQ1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim12aQ99PQ1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim12aQ99PQ1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim12aQ99PQ1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim12aQ99PQ1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim12aQ99PQ1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim12aQ99PQ1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim12aQ99PQ1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Trim12aQ99PQ1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trim12aQ99PQ1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim12aQ99PQ1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim12aQ99PQ1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim12aQ99PQ1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim12aQ99PQ1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim12aQ99PQ1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim12aQ99PQ1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trim12aQ99PQ1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim12aQ99PQ1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim12aQ99PQ1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trim12aQ99PQ1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim12aQ99PQ1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim12aQ99PQ1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim12aQ99PQ1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim12aQ99PQ1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim12aQ99PQ1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim12aQ99PQ1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim12aQ99PQ1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim12aQ99PQ1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trim12aQ99PQ1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim12aQ99PQ1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trim12aQ99PQ1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim12aQ99PQ1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim12aQ99PQ1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Trim12aQ99PQ1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim12aQ99PQ1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim12aQ99PQ1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trim12aQ99PQ1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms