Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL6

Ubxn6, UBX domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn6Q99PL6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ubxn6Q99PL6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ubxn6Q99PL6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ubxn6Q99PL6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ubxn6Q99PL6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ubxn6Q99PL6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ubxn6Q99PL6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ubxn6Q99PL6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ubxn6Q99PL6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ubxn6Q99PL6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ubxn6Q99PL6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ubxn6Q99PL6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ubxn6Q99PL6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ubxn6Q99PL6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ubxn6Q99PL6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ubxn6Q99PL6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ubxn6Q99PL6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ubxn6Q99PL6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ubxn6Q99PL6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ubxn6Q99PL6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ubxn6Q99PL6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ubxn6Q99PL6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ubxn6Q99PL6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Ubxn6Q99PL6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ubxn6Q99PL6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ubxn6Q99PL6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Ubxn6Q99PL6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ubxn6Q99PL6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ubxn6Q99PL6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ubxn6Q99PL6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ubxn6Q99PL6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ubxn6Q99PL6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ubxn6Q99PL6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ubxn6Q99PL6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ubxn6Q99PL6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ubxn6Q99PL6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ubxn6Q99PL6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Ubxn6Q99PL6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ubxn6Q99PL6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ubxn6Q99PL6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ubxn6Q99PL6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ubxn6Q99PL6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ubxn6Q99PL6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ubxn6Q99PL6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ubxn6Q99PL6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ubxn6Q99PL6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ubxn6Q99PL6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ubxn6Q99PL6 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ubxn6Q99PL6 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ubxn6Q99PL6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ubxn6Q99PL6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ubxn6Q99PL6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ubxn6Q99PL6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ubxn6Q99PL6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ubxn6Q99PL6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ubxn6Q99PL6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ubxn6Q99PL6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ubxn6Q99PL6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ubxn6Q99PL6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Ubxn6Q99PL6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ubxn6Q99PL6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ubxn6Q99PL6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ubxn6Q99PL6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ubxn6Q99PL6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ubxn6Q99PL6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ubxn6Q99PL6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ubxn6Q99PL6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ubxn6Q99PL6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ubxn6Q99PL6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ubxn6Q99PL6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ubxn6Q99PL6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ubxn6Q99PL6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ubxn6Q99PL6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ubxn6Q99PL6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ubxn6Q99PL6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ubxn6Q99PL6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ubxn6Q99PL6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ubxn6Q99PL6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ubxn6Q99PL6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ubxn6Q99PL6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ubxn6Q99PL6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ubxn6Q99PL6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ubxn6Q99PL6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ubxn6Q99PL6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ubxn6Q99PL6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ubxn6Q99PL6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ubxn6Q99PL6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ubxn6Q99PL6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ubxn6Q99PL6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Ubxn6Q99PL6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ubxn6Q99PL6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ubxn6Q99PL6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ubxn6Q99PL6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ubxn6Q99PL6 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ubxn6Q99PL6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ubxn6Q99PL6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ubxn6Q99PL6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ubxn6Q99PL6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ubxn6Q99PL6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ubxn6Q99PL6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms