Protein–RNA interactions for Protein: Q99N08

Ms4a6c, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6C, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6cQ99N08 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ms4a6cQ99N08 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ms4a6cQ99N08 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ms4a6cQ99N08 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ms4a6cQ99N08 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ms4a6cQ99N08 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ms4a6cQ99N08 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ms4a6cQ99N08 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ms4a6cQ99N08 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ms4a6cQ99N08 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ms4a6cQ99N08 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ms4a6cQ99N08 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ms4a6cQ99N08 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ms4a6cQ99N08 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ms4a6cQ99N08 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ms4a6cQ99N08 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ms4a6cQ99N08 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ms4a6cQ99N08 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ms4a6cQ99N08 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ms4a6cQ99N08 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ms4a6cQ99N08 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Ms4a6cQ99N08 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ms4a6cQ99N08 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ms4a6cQ99N08 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ms4a6cQ99N08 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ms4a6cQ99N08 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ms4a6cQ99N08 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ms4a6cQ99N08 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ms4a6cQ99N08 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ms4a6cQ99N08 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ms4a6cQ99N08 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ms4a6cQ99N08 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ms4a6cQ99N08 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ms4a6cQ99N08 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ms4a6cQ99N08 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ms4a6cQ99N08 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ms4a6cQ99N08 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ms4a6cQ99N08 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ms4a6cQ99N08 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ms4a6cQ99N08 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ms4a6cQ99N08 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ms4a6cQ99N08 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ms4a6cQ99N08 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ms4a6cQ99N08 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ms4a6cQ99N08 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ms4a6cQ99N08 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ms4a6cQ99N08 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ms4a6cQ99N08 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ms4a6cQ99N08 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ms4a6cQ99N08 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ms4a6cQ99N08 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ms4a6cQ99N08 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ms4a6cQ99N08 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ms4a6cQ99N08 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ms4a6cQ99N08 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ms4a6cQ99N08 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ms4a6cQ99N08 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ms4a6cQ99N08 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ms4a6cQ99N08 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ms4a6cQ99N08 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ms4a6cQ99N08 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ms4a6cQ99N08 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ms4a6cQ99N08 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ms4a6cQ99N08 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ms4a6cQ99N08 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ms4a6cQ99N08 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ms4a6cQ99N08 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ms4a6cQ99N08 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ms4a6cQ99N08 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ms4a6cQ99N08 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ms4a6cQ99N08 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ms4a6cQ99N08 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ms4a6cQ99N08 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ms4a6cQ99N08 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ms4a6cQ99N08 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ms4a6cQ99N08 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ms4a6cQ99N08 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ms4a6cQ99N08 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ms4a6cQ99N08 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ms4a6cQ99N08 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ms4a6cQ99N08 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ms4a6cQ99N08 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ms4a6cQ99N08 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ms4a6cQ99N08 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ms4a6cQ99N08 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ms4a6cQ99N08 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ms4a6cQ99N08 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ms4a6cQ99N08 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Ms4a6cQ99N08 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ms4a6cQ99N08 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ms4a6cQ99N08 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ms4a6cQ99N08 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ms4a6cQ99N08 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ms4a6cQ99N08 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ms4a6cQ99N08 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Ms4a6cQ99N08 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ms4a6cQ99N08 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ms4a6cQ99N08 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ms4a6cQ99N08 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ms4a6cQ99N08 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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