Protein–RNA interactions for Protein: Q99MP3

Calcb, Calcitonin gene-related peptide 2, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CalcbQ99MP3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CalcbQ99MP3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CalcbQ99MP3 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CalcbQ99MP3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CalcbQ99MP3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CalcbQ99MP3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CalcbQ99MP3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CalcbQ99MP3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CalcbQ99MP3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CalcbQ99MP3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CalcbQ99MP3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CalcbQ99MP3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CalcbQ99MP3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CalcbQ99MP3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CalcbQ99MP3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CalcbQ99MP3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CalcbQ99MP3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CalcbQ99MP3 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CalcbQ99MP3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CalcbQ99MP3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CalcbQ99MP3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CalcbQ99MP3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CalcbQ99MP3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CalcbQ99MP3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CalcbQ99MP3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CalcbQ99MP3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CalcbQ99MP3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CalcbQ99MP3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CalcbQ99MP3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CalcbQ99MP3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CalcbQ99MP3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CalcbQ99MP3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CalcbQ99MP3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CalcbQ99MP3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CalcbQ99MP3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CalcbQ99MP3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CalcbQ99MP3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CalcbQ99MP3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CalcbQ99MP3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CalcbQ99MP3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CalcbQ99MP3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CalcbQ99MP3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CalcbQ99MP3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CalcbQ99MP3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CalcbQ99MP3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CalcbQ99MP3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CalcbQ99MP3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CalcbQ99MP3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CalcbQ99MP3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CalcbQ99MP3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CalcbQ99MP3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CalcbQ99MP3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CalcbQ99MP3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CalcbQ99MP3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CalcbQ99MP3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CalcbQ99MP3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CalcbQ99MP3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CalcbQ99MP3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CalcbQ99MP3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CalcbQ99MP3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CalcbQ99MP3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CalcbQ99MP3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CalcbQ99MP3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CalcbQ99MP3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CalcbQ99MP3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CalcbQ99MP3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CalcbQ99MP3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CalcbQ99MP3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CalcbQ99MP3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CalcbQ99MP3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CalcbQ99MP3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CalcbQ99MP3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CalcbQ99MP3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CalcbQ99MP3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CalcbQ99MP3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CalcbQ99MP3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CalcbQ99MP3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CalcbQ99MP3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CalcbQ99MP3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CalcbQ99MP3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CalcbQ99MP3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CalcbQ99MP3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CalcbQ99MP3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CalcbQ99MP3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CalcbQ99MP3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CalcbQ99MP3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CalcbQ99MP3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CalcbQ99MP3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CalcbQ99MP3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CalcbQ99MP3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CalcbQ99MP3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CalcbQ99MP3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CalcbQ99MP3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CalcbQ99MP3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CalcbQ99MP3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CalcbQ99MP3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CalcbQ99MP3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CalcbQ99MP3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CalcbQ99MP3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CalcbQ99MP3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms