Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME3

Sncaip, Synphilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncaipQ99ME3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SncaipQ99ME3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SncaipQ99ME3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SncaipQ99ME3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SncaipQ99ME3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SncaipQ99ME3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SncaipQ99ME3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SncaipQ99ME3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SncaipQ99ME3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SncaipQ99ME3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SncaipQ99ME3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SncaipQ99ME3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SncaipQ99ME3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SncaipQ99ME3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SncaipQ99ME3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SncaipQ99ME3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SncaipQ99ME3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SncaipQ99ME3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SncaipQ99ME3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SncaipQ99ME3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SncaipQ99ME3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SncaipQ99ME3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SncaipQ99ME3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SncaipQ99ME3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SncaipQ99ME3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SncaipQ99ME3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SncaipQ99ME3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SncaipQ99ME3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SncaipQ99ME3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SncaipQ99ME3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SncaipQ99ME3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SncaipQ99ME3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SncaipQ99ME3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SncaipQ99ME3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SncaipQ99ME3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SncaipQ99ME3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SncaipQ99ME3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SncaipQ99ME3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SncaipQ99ME3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SncaipQ99ME3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SncaipQ99ME3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SncaipQ99ME3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SncaipQ99ME3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SncaipQ99ME3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SncaipQ99ME3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SncaipQ99ME3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SncaipQ99ME3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SncaipQ99ME3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SncaipQ99ME3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SncaipQ99ME3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SncaipQ99ME3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SncaipQ99ME3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SncaipQ99ME3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SncaipQ99ME3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SncaipQ99ME3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SncaipQ99ME3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SncaipQ99ME3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SncaipQ99ME3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SncaipQ99ME3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SncaipQ99ME3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SncaipQ99ME3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SncaipQ99ME3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SncaipQ99ME3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SncaipQ99ME3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SncaipQ99ME3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SncaipQ99ME3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SncaipQ99ME3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SncaipQ99ME3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SncaipQ99ME3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SncaipQ99ME3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SncaipQ99ME3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SncaipQ99ME3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SncaipQ99ME3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SncaipQ99ME3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SncaipQ99ME3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
SncaipQ99ME3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SncaipQ99ME3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SncaipQ99ME3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SncaipQ99ME3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SncaipQ99ME3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SncaipQ99ME3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SncaipQ99ME3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SncaipQ99ME3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SncaipQ99ME3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SncaipQ99ME3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SncaipQ99ME3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SncaipQ99ME3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SncaipQ99ME3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SncaipQ99ME3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SncaipQ99ME3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SncaipQ99ME3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SncaipQ99ME3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SncaipQ99ME3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SncaipQ99ME3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SncaipQ99ME3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SncaipQ99ME3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SncaipQ99ME3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SncaipQ99ME3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SncaipQ99ME3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SncaipQ99ME3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.6 ms