Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gdpd3Q99LY2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gdpd3Q99LY2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gdpd3Q99LY2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gdpd3Q99LY2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gdpd3Q99LY2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gdpd3Q99LY2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gdpd3Q99LY2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gdpd3Q99LY2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gdpd3Q99LY2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gdpd3Q99LY2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gdpd3Q99LY2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gdpd3Q99LY2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gdpd3Q99LY2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gdpd3Q99LY2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gdpd3Q99LY2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gdpd3Q99LY2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gdpd3Q99LY2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gdpd3Q99LY2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gdpd3Q99LY2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gdpd3Q99LY2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gdpd3Q99LY2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gdpd3Q99LY2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gdpd3Q99LY2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Gdpd3Q99LY2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gdpd3Q99LY2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gdpd3Q99LY2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gdpd3Q99LY2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gdpd3Q99LY2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gdpd3Q99LY2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gdpd3Q99LY2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gdpd3Q99LY2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gdpd3Q99LY2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gdpd3Q99LY2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gdpd3Q99LY2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gdpd3Q99LY2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gdpd3Q99LY2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gdpd3Q99LY2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gdpd3Q99LY2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gdpd3Q99LY2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gdpd3Q99LY2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gdpd3Q99LY2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gdpd3Q99LY2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gdpd3Q99LY2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gdpd3Q99LY2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gdpd3Q99LY2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gdpd3Q99LY2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gdpd3Q99LY2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gdpd3Q99LY2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gdpd3Q99LY2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gdpd3Q99LY2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gdpd3Q99LY2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gdpd3Q99LY2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gdpd3Q99LY2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gdpd3Q99LY2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gdpd3Q99LY2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Gdpd3Q99LY2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gdpd3Q99LY2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Gdpd3Q99LY2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gdpd3Q99LY2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gdpd3Q99LY2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gdpd3Q99LY2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Gdpd3Q99LY2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gdpd3Q99LY2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gdpd3Q99LY2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gdpd3Q99LY2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gdpd3Q99LY2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Gdpd3Q99LY2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gdpd3Q99LY2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gdpd3Q99LY2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gdpd3Q99LY2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gdpd3Q99LY2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Gdpd3Q99LY2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gdpd3Q99LY2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gdpd3Q99LY2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gdpd3Q99LY2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gdpd3Q99LY2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Gdpd3Q99LY2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gdpd3Q99LY2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gdpd3Q99LY2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gdpd3Q99LY2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gdpd3Q99LY2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gdpd3Q99LY2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gdpd3Q99LY2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gdpd3Q99LY2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gdpd3Q99LY2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gdpd3Q99LY2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gdpd3Q99LY2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gdpd3Q99LY2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gdpd3Q99LY2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gdpd3Q99LY2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gdpd3Q99LY2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gdpd3Q99LY2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gdpd3Q99LY2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gdpd3Q99LY2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gdpd3Q99LY2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gdpd3Q99LY2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gdpd3Q99LY2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gdpd3Q99LY2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gdpd3Q99LY2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms