Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG4

Ttc5, Tetratricopeptide repeat protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc5Q99LG4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ttc5Q99LG4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ttc5Q99LG4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ttc5Q99LG4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ttc5Q99LG4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ttc5Q99LG4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ttc5Q99LG4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ttc5Q99LG4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ttc5Q99LG4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ttc5Q99LG4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ttc5Q99LG4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ttc5Q99LG4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Ttc5Q99LG4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ttc5Q99LG4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ttc5Q99LG4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ttc5Q99LG4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ttc5Q99LG4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ttc5Q99LG4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ttc5Q99LG4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ttc5Q99LG4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ttc5Q99LG4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ttc5Q99LG4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Ttc5Q99LG4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ttc5Q99LG4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ttc5Q99LG4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ttc5Q99LG4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ttc5Q99LG4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ttc5Q99LG4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ttc5Q99LG4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Ttc5Q99LG4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ttc5Q99LG4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ttc5Q99LG4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ttc5Q99LG4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ttc5Q99LG4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ttc5Q99LG4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Ttc5Q99LG4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ttc5Q99LG4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ttc5Q99LG4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ttc5Q99LG4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ttc5Q99LG4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ttc5Q99LG4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ttc5Q99LG4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ttc5Q99LG4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Ttc5Q99LG4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ttc5Q99LG4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ttc5Q99LG4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ttc5Q99LG4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Ttc5Q99LG4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ttc5Q99LG4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ttc5Q99LG4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ttc5Q99LG4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ttc5Q99LG4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ttc5Q99LG4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ttc5Q99LG4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ttc5Q99LG4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ttc5Q99LG4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ttc5Q99LG4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ttc5Q99LG4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ttc5Q99LG4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ttc5Q99LG4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Ttc5Q99LG4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ttc5Q99LG4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ttc5Q99LG4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ttc5Q99LG4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ttc5Q99LG4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ttc5Q99LG4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ttc5Q99LG4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ttc5Q99LG4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ttc5Q99LG4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ttc5Q99LG4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ttc5Q99LG4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Ttc5Q99LG4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ttc5Q99LG4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Ttc5Q99LG4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ttc5Q99LG4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ttc5Q99LG4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ttc5Q99LG4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ttc5Q99LG4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Ttc5Q99LG4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ttc5Q99LG4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Ttc5Q99LG4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Ttc5Q99LG4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ttc5Q99LG4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ttc5Q99LG4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ttc5Q99LG4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ttc5Q99LG4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ttc5Q99LG4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Ttc5Q99LG4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ttc5Q99LG4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ttc5Q99LG4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ttc5Q99LG4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ttc5Q99LG4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ttc5Q99LG4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Ttc5Q99LG4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ttc5Q99LG4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ttc5Q99LG4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ttc5Q99LG4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ttc5Q99LG4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Ttc5Q99LG4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ttc5Q99LG4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms