Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TrabdQ99JY4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TrabdQ99JY4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TrabdQ99JY4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TrabdQ99JY4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TrabdQ99JY4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TrabdQ99JY4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TrabdQ99JY4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TrabdQ99JY4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TrabdQ99JY4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TrabdQ99JY4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TrabdQ99JY4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TrabdQ99JY4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TrabdQ99JY4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TrabdQ99JY4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TrabdQ99JY4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TrabdQ99JY4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TrabdQ99JY4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TrabdQ99JY4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TrabdQ99JY4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TrabdQ99JY4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TrabdQ99JY4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TrabdQ99JY4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TrabdQ99JY4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TrabdQ99JY4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TrabdQ99JY4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TrabdQ99JY4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TrabdQ99JY4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TrabdQ99JY4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TrabdQ99JY4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TrabdQ99JY4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TrabdQ99JY4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TrabdQ99JY4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TrabdQ99JY4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TrabdQ99JY4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TrabdQ99JY4 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TrabdQ99JY4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TrabdQ99JY4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TrabdQ99JY4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TrabdQ99JY4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TrabdQ99JY4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TrabdQ99JY4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TrabdQ99JY4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TrabdQ99JY4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TrabdQ99JY4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TrabdQ99JY4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TrabdQ99JY4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TrabdQ99JY4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TrabdQ99JY4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TrabdQ99JY4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TrabdQ99JY4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TrabdQ99JY4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TrabdQ99JY4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TrabdQ99JY4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TrabdQ99JY4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TrabdQ99JY4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TrabdQ99JY4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TrabdQ99JY4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TrabdQ99JY4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TrabdQ99JY4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TrabdQ99JY4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TrabdQ99JY4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TrabdQ99JY4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TrabdQ99JY4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TrabdQ99JY4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TrabdQ99JY4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TrabdQ99JY4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TrabdQ99JY4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TrabdQ99JY4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TrabdQ99JY4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TrabdQ99JY4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TrabdQ99JY4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TrabdQ99JY4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TrabdQ99JY4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TrabdQ99JY4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TrabdQ99JY4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TrabdQ99JY4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TrabdQ99JY4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TrabdQ99JY4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TrabdQ99JY4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TrabdQ99JY4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TrabdQ99JY4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TrabdQ99JY4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TrabdQ99JY4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TrabdQ99JY4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TrabdQ99JY4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TrabdQ99JY4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TrabdQ99JY4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TrabdQ99JY4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TrabdQ99JY4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TrabdQ99JY4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TrabdQ99JY4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TrabdQ99JY4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TrabdQ99JY4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TrabdQ99JY4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TrabdQ99JY4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TrabdQ99JY4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TrabdQ99JY4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TrabdQ99JY4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TrabdQ99JY4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms