Protein–RNA interactions for Protein: Q99J87

Dhx58, Probable ATP-dependent RNA helicase DHX58, mousemouse

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dhx58Q99J87 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Dhx58Q99J87 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Dhx58Q99J87 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dhx58Q99J87 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dhx58Q99J87 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dhx58Q99J87 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Dhx58Q99J87 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Dhx58Q99J87 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Dhx58Q99J87 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Dhx58Q99J87 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Dhx58Q99J87 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Dhx58Q99J87 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Dhx58Q99J87 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Dhx58Q99J87 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Dhx58Q99J87 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dhx58Q99J87 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dhx58Q99J87 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dhx58Q99J87 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Dhx58Q99J87 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dhx58Q99J87 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dhx58Q99J87 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dhx58Q99J87 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dhx58Q99J87 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dhx58Q99J87 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dhx58Q99J87 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dhx58Q99J87 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Dhx58Q99J87 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dhx58Q99J87 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dhx58Q99J87 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dhx58Q99J87 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dhx58Q99J87 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dhx58Q99J87 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Dhx58Q99J87 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Dhx58Q99J87 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dhx58Q99J87 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dhx58Q99J87 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dhx58Q99J87 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Dhx58Q99J87 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dhx58Q99J87 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dhx58Q99J87 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dhx58Q99J87 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dhx58Q99J87 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dhx58Q99J87 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dhx58Q99J87 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dhx58Q99J87 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dhx58Q99J87 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dhx58Q99J87 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Dhx58Q99J87 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Dhx58Q99J87 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Dhx58Q99J87 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Dhx58Q99J87 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Dhx58Q99J87 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Dhx58Q99J87 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Dhx58Q99J87 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Dhx58Q99J87 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Dhx58Q99J87 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Dhx58Q99J87 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Dhx58Q99J87 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Dhx58Q99J87 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Dhx58Q99J87 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Dhx58Q99J87 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dhx58Q99J87 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dhx58Q99J87 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dhx58Q99J87 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dhx58Q99J87 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dhx58Q99J87 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dhx58Q99J87 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Dhx58Q99J87 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dhx58Q99J87 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dhx58Q99J87 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dhx58Q99J87 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dhx58Q99J87 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Dhx58Q99J87 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Dhx58Q99J87 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Dhx58Q99J87 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Dhx58Q99J87 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Dhx58Q99J87 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Dhx58Q99J87 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Dhx58Q99J87 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Dhx58Q99J87 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Dhx58Q99J87 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Dhx58Q99J87 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Dhx58Q99J87 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Dhx58Q99J87 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Dhx58Q99J87 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Dhx58Q99J87 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Dhx58Q99J87 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Dhx58Q99J87 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Dhx58Q99J87 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Dhx58Q99J87 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Dhx58Q99J87 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Dhx58Q99J87 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Dhx58Q99J87 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Dhx58Q99J87 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Dhx58Q99J87 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Dhx58Q99J87 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Dhx58Q99J87 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Dhx58Q99J87 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Dhx58Q99J87 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Dhx58Q99J87 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96 ms