Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Apobec3Q99J72 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Apobec3Q99J72 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Apobec3Q99J72 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Apobec3Q99J72 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Apobec3Q99J72 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Apobec3Q99J72 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Apobec3Q99J72 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Apobec3Q99J72 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Apobec3Q99J72 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Apobec3Q99J72 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Apobec3Q99J72 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Apobec3Q99J72 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Apobec3Q99J72 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Apobec3Q99J72 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Apobec3Q99J72 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Apobec3Q99J72 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Apobec3Q99J72 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Apobec3Q99J72 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Apobec3Q99J72 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Apobec3Q99J72 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Apobec3Q99J72 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Apobec3Q99J72 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Apobec3Q99J72 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Apobec3Q99J72 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Apobec3Q99J72 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Apobec3Q99J72 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Apobec3Q99J72 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Apobec3Q99J72 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Apobec3Q99J72 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Apobec3Q99J72 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Apobec3Q99J72 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Apobec3Q99J72 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Apobec3Q99J72 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Apobec3Q99J72 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Apobec3Q99J72 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Apobec3Q99J72 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Apobec3Q99J72 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Apobec3Q99J72 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Apobec3Q99J72 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Apobec3Q99J72 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Apobec3Q99J72 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Apobec3Q99J72 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Apobec3Q99J72 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Apobec3Q99J72 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Apobec3Q99J72 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Apobec3Q99J72 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Apobec3Q99J72 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Apobec3Q99J72 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Apobec3Q99J72 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Apobec3Q99J72 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Apobec3Q99J72 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Apobec3Q99J72 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Apobec3Q99J72 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Apobec3Q99J72 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Apobec3Q99J72 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Apobec3Q99J72 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Apobec3Q99J72 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Apobec3Q99J72 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Apobec3Q99J72 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Apobec3Q99J72 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Apobec3Q99J72 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Apobec3Q99J72 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Apobec3Q99J72 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Apobec3Q99J72 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Apobec3Q99J72 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Apobec3Q99J72 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Apobec3Q99J72 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Apobec3Q99J72 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Apobec3Q99J72 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Apobec3Q99J72 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Apobec3Q99J72 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Apobec3Q99J72 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Apobec3Q99J72 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Apobec3Q99J72 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Apobec3Q99J72 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Apobec3Q99J72 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Apobec3Q99J72 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Apobec3Q99J72 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Apobec3Q99J72 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Apobec3Q99J72 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Apobec3Q99J72 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Apobec3Q99J72 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Apobec3Q99J72 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Apobec3Q99J72 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Apobec3Q99J72 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Apobec3Q99J72 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Apobec3Q99J72 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Apobec3Q99J72 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Apobec3Q99J72 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Apobec3Q99J72 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Apobec3Q99J72 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Apobec3Q99J72 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Apobec3Q99J72 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Apobec3Q99J72 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Apobec3Q99J72 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Apobec3Q99J72 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Apobec3Q99J72 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Apobec3Q99J72 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Apobec3Q99J72 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 154.7 ms