Protein–RNA interactions for Protein: Q924S8

Spred1, Sprouty-related, EVH1 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spred1Q924S8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Spred1Q924S8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Spred1Q924S8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Spred1Q924S8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Spred1Q924S8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Spred1Q924S8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Spred1Q924S8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Spred1Q924S8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Spred1Q924S8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Spred1Q924S8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Spred1Q924S8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Spred1Q924S8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Spred1Q924S8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Spred1Q924S8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Spred1Q924S8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Spred1Q924S8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Spred1Q924S8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Spred1Q924S8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Spred1Q924S8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Spred1Q924S8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Spred1Q924S8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Spred1Q924S8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Spred1Q924S8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Spred1Q924S8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Spred1Q924S8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Spred1Q924S8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Spred1Q924S8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Spred1Q924S8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Spred1Q924S8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Spred1Q924S8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Spred1Q924S8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Spred1Q924S8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Spred1Q924S8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Spred1Q924S8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Spred1Q924S8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Spred1Q924S8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Spred1Q924S8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Spred1Q924S8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Spred1Q924S8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Spred1Q924S8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Spred1Q924S8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Spred1Q924S8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Spred1Q924S8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Spred1Q924S8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Spred1Q924S8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Spred1Q924S8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Spred1Q924S8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Spred1Q924S8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Spred1Q924S8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Spred1Q924S8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Spred1Q924S8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Spred1Q924S8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Spred1Q924S8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Spred1Q924S8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Spred1Q924S8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Spred1Q924S8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Spred1Q924S8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Spred1Q924S8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Spred1Q924S8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Spred1Q924S8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Spred1Q924S8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Spred1Q924S8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Spred1Q924S8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Spred1Q924S8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Spred1Q924S8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Spred1Q924S8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Spred1Q924S8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Spred1Q924S8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Spred1Q924S8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Spred1Q924S8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Spred1Q924S8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Spred1Q924S8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Spred1Q924S8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Spred1Q924S8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Spred1Q924S8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Spred1Q924S8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Spred1Q924S8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Spred1Q924S8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Spred1Q924S8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Spred1Q924S8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Spred1Q924S8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Spred1Q924S8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Spred1Q924S8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Spred1Q924S8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Spred1Q924S8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Spred1Q924S8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Spred1Q924S8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Spred1Q924S8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Spred1Q924S8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Spred1Q924S8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Spred1Q924S8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Spred1Q924S8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Spred1Q924S8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Spred1Q924S8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Spred1Q924S8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Spred1Q924S8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Spred1Q924S8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Spred1Q924S8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Spred1Q924S8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Spred1Q924S8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms