Protein–RNA interactions for Protein: Q923Z4

Ferd3l, Fer3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ferd3lQ923Z4 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ferd3lQ923Z4 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ferd3lQ923Z4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ferd3lQ923Z4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ferd3lQ923Z4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ferd3lQ923Z4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ferd3lQ923Z4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ferd3lQ923Z4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ferd3lQ923Z4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ferd3lQ923Z4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ferd3lQ923Z4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ferd3lQ923Z4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ferd3lQ923Z4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ferd3lQ923Z4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ferd3lQ923Z4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ferd3lQ923Z4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ferd3lQ923Z4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ferd3lQ923Z4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ferd3lQ923Z4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ferd3lQ923Z4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ferd3lQ923Z4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ferd3lQ923Z4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ferd3lQ923Z4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ferd3lQ923Z4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ferd3lQ923Z4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ferd3lQ923Z4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ferd3lQ923Z4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ferd3lQ923Z4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ferd3lQ923Z4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ferd3lQ923Z4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ferd3lQ923Z4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ferd3lQ923Z4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ferd3lQ923Z4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ferd3lQ923Z4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ferd3lQ923Z4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ferd3lQ923Z4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ferd3lQ923Z4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ferd3lQ923Z4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ferd3lQ923Z4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ferd3lQ923Z4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ferd3lQ923Z4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ferd3lQ923Z4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ferd3lQ923Z4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ferd3lQ923Z4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ferd3lQ923Z4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ferd3lQ923Z4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ferd3lQ923Z4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ferd3lQ923Z4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ferd3lQ923Z4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ferd3lQ923Z4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ferd3lQ923Z4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ferd3lQ923Z4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ferd3lQ923Z4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ferd3lQ923Z4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ferd3lQ923Z4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ferd3lQ923Z4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ferd3lQ923Z4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ferd3lQ923Z4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ferd3lQ923Z4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ferd3lQ923Z4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ferd3lQ923Z4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ferd3lQ923Z4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ferd3lQ923Z4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ferd3lQ923Z4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ferd3lQ923Z4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ferd3lQ923Z4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ferd3lQ923Z4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ferd3lQ923Z4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ferd3lQ923Z4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ferd3lQ923Z4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ferd3lQ923Z4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ferd3lQ923Z4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ferd3lQ923Z4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ferd3lQ923Z4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ferd3lQ923Z4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ferd3lQ923Z4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ferd3lQ923Z4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ferd3lQ923Z4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ferd3lQ923Z4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ferd3lQ923Z4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ferd3lQ923Z4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ferd3lQ923Z4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ferd3lQ923Z4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ferd3lQ923Z4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ferd3lQ923Z4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ferd3lQ923Z4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ferd3lQ923Z4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ferd3lQ923Z4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ferd3lQ923Z4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ferd3lQ923Z4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ferd3lQ923Z4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ferd3lQ923Z4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ferd3lQ923Z4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ferd3lQ923Z4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ferd3lQ923Z4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ferd3lQ923Z4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ferd3lQ923Z4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ferd3lQ923Z4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ferd3lQ923Z4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ferd3lQ923Z4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms