Protein–RNA interactions for Protein: Q923D4

Sf3b5, Splicing factor 3B subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b5Q923D4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sf3b5Q923D4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sf3b5Q923D4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sf3b5Q923D4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sf3b5Q923D4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sf3b5Q923D4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Sf3b5Q923D4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sf3b5Q923D4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sf3b5Q923D4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sf3b5Q923D4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sf3b5Q923D4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sf3b5Q923D4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sf3b5Q923D4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sf3b5Q923D4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sf3b5Q923D4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sf3b5Q923D4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sf3b5Q923D4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sf3b5Q923D4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sf3b5Q923D4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Sf3b5Q923D4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sf3b5Q923D4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sf3b5Q923D4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sf3b5Q923D4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sf3b5Q923D4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sf3b5Q923D4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sf3b5Q923D4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Sf3b5Q923D4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sf3b5Q923D4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sf3b5Q923D4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sf3b5Q923D4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sf3b5Q923D4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sf3b5Q923D4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sf3b5Q923D4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sf3b5Q923D4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sf3b5Q923D4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sf3b5Q923D4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sf3b5Q923D4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sf3b5Q923D4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sf3b5Q923D4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sf3b5Q923D4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sf3b5Q923D4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sf3b5Q923D4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sf3b5Q923D4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sf3b5Q923D4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sf3b5Q923D4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sf3b5Q923D4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sf3b5Q923D4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sf3b5Q923D4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Sf3b5Q923D4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Sf3b5Q923D4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sf3b5Q923D4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sf3b5Q923D4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sf3b5Q923D4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Sf3b5Q923D4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Sf3b5Q923D4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Sf3b5Q923D4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Sf3b5Q923D4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sf3b5Q923D4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Sf3b5Q923D4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sf3b5Q923D4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sf3b5Q923D4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Sf3b5Q923D4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Sf3b5Q923D4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sf3b5Q923D4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Sf3b5Q923D4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sf3b5Q923D4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sf3b5Q923D4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sf3b5Q923D4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sf3b5Q923D4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sf3b5Q923D4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Sf3b5Q923D4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sf3b5Q923D4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sf3b5Q923D4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sf3b5Q923D4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sf3b5Q923D4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sf3b5Q923D4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sf3b5Q923D4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sf3b5Q923D4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sf3b5Q923D4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sf3b5Q923D4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sf3b5Q923D4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sf3b5Q923D4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Sf3b5Q923D4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Sf3b5Q923D4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sf3b5Q923D4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sf3b5Q923D4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sf3b5Q923D4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sf3b5Q923D4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sf3b5Q923D4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sf3b5Q923D4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sf3b5Q923D4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sf3b5Q923D4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sf3b5Q923D4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Sf3b5Q923D4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sf3b5Q923D4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sf3b5Q923D4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sf3b5Q923D4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sf3b5Q923D4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sf3b5Q923D4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sf3b5Q923D4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms