Protein–RNA interactions for Protein: Q922Q2

Riok1, Serine/threonine-protein kinase RIO1, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok1Q922Q2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Riok1Q922Q2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Riok1Q922Q2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Riok1Q922Q2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Riok1Q922Q2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Riok1Q922Q2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Riok1Q922Q2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Riok1Q922Q2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Riok1Q922Q2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Riok1Q922Q2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Riok1Q922Q2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Riok1Q922Q2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Riok1Q922Q2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Riok1Q922Q2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Riok1Q922Q2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Riok1Q922Q2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Riok1Q922Q2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Riok1Q922Q2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Riok1Q922Q2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Riok1Q922Q2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Riok1Q922Q2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Riok1Q922Q2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Riok1Q922Q2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Riok1Q922Q2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Riok1Q922Q2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Riok1Q922Q2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Riok1Q922Q2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Riok1Q922Q2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Riok1Q922Q2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Riok1Q922Q2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Riok1Q922Q2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Riok1Q922Q2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Riok1Q922Q2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Riok1Q922Q2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Riok1Q922Q2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Riok1Q922Q2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Riok1Q922Q2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Riok1Q922Q2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Riok1Q922Q2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Riok1Q922Q2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Riok1Q922Q2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Riok1Q922Q2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Riok1Q922Q2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Riok1Q922Q2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Riok1Q922Q2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Riok1Q922Q2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Riok1Q922Q2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Riok1Q922Q2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Riok1Q922Q2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Riok1Q922Q2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Riok1Q922Q2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Riok1Q922Q2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Riok1Q922Q2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Riok1Q922Q2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Riok1Q922Q2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Riok1Q922Q2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Riok1Q922Q2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Riok1Q922Q2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Riok1Q922Q2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Riok1Q922Q2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Riok1Q922Q2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Riok1Q922Q2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Riok1Q922Q2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Riok1Q922Q2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Riok1Q922Q2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Riok1Q922Q2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Riok1Q922Q2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Riok1Q922Q2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Riok1Q922Q2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Riok1Q922Q2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Riok1Q922Q2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Riok1Q922Q2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Riok1Q922Q2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Riok1Q922Q2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Riok1Q922Q2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Riok1Q922Q2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Riok1Q922Q2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Riok1Q922Q2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Riok1Q922Q2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Riok1Q922Q2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Riok1Q922Q2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Riok1Q922Q2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Riok1Q922Q2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Riok1Q922Q2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Riok1Q922Q2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Riok1Q922Q2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Riok1Q922Q2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Riok1Q922Q2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Riok1Q922Q2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Riok1Q922Q2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Riok1Q922Q2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Riok1Q922Q2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Riok1Q922Q2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Riok1Q922Q2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Riok1Q922Q2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Riok1Q922Q2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Riok1Q922Q2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Riok1Q922Q2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Riok1Q922Q2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Riok1Q922Q2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms