Protein–RNA interactions for Protein: Q921I6

Sh3bp4, SH3 domain-binding protein 4, mousemouse

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Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp4Q921I6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sh3bp4Q921I6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sh3bp4Q921I6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sh3bp4Q921I6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sh3bp4Q921I6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh3bp4Q921I6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh3bp4Q921I6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh3bp4Q921I6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh3bp4Q921I6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sh3bp4Q921I6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh3bp4Q921I6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh3bp4Q921I6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh3bp4Q921I6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh3bp4Q921I6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sh3bp4Q921I6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh3bp4Q921I6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sh3bp4Q921I6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh3bp4Q921I6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh3bp4Q921I6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh3bp4Q921I6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh3bp4Q921I6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sh3bp4Q921I6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh3bp4Q921I6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sh3bp4Q921I6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sh3bp4Q921I6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sh3bp4Q921I6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sh3bp4Q921I6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sh3bp4Q921I6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sh3bp4Q921I6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sh3bp4Q921I6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sh3bp4Q921I6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sh3bp4Q921I6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sh3bp4Q921I6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Sh3bp4Q921I6 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sh3bp4Q921I6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sh3bp4Q921I6 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sh3bp4Q921I6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sh3bp4Q921I6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sh3bp4Q921I6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sh3bp4Q921I6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sh3bp4Q921I6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sh3bp4Q921I6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Sh3bp4Q921I6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sh3bp4Q921I6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sh3bp4Q921I6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sh3bp4Q921I6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sh3bp4Q921I6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sh3bp4Q921I6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sh3bp4Q921I6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sh3bp4Q921I6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sh3bp4Q921I6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sh3bp4Q921I6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sh3bp4Q921I6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sh3bp4Q921I6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sh3bp4Q921I6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sh3bp4Q921I6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sh3bp4Q921I6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sh3bp4Q921I6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sh3bp4Q921I6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sh3bp4Q921I6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sh3bp4Q921I6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sh3bp4Q921I6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sh3bp4Q921I6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sh3bp4Q921I6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sh3bp4Q921I6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Sh3bp4Q921I6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sh3bp4Q921I6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sh3bp4Q921I6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sh3bp4Q921I6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sh3bp4Q921I6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sh3bp4Q921I6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sh3bp4Q921I6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sh3bp4Q921I6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sh3bp4Q921I6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sh3bp4Q921I6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sh3bp4Q921I6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sh3bp4Q921I6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Sh3bp4Q921I6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Sh3bp4Q921I6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sh3bp4Q921I6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sh3bp4Q921I6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sh3bp4Q921I6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sh3bp4Q921I6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sh3bp4Q921I6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sh3bp4Q921I6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sh3bp4Q921I6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sh3bp4Q921I6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sh3bp4Q921I6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sh3bp4Q921I6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sh3bp4Q921I6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Sh3bp4Q921I6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sh3bp4Q921I6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sh3bp4Q921I6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh3bp4Q921I6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh3bp4Q921I6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh3bp4Q921I6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh3bp4Q921I6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sh3bp4Q921I6 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sh3bp4Q921I6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sh3bp4Q921I6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
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