Protein–RNA interactions for Protein: Q920E5

Fdps, Farnesyl pyrophosphate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FdpsQ920E5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FdpsQ920E5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FdpsQ920E5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FdpsQ920E5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FdpsQ920E5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FdpsQ920E5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FdpsQ920E5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FdpsQ920E5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FdpsQ920E5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FdpsQ920E5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FdpsQ920E5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FdpsQ920E5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FdpsQ920E5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FdpsQ920E5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FdpsQ920E5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FdpsQ920E5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FdpsQ920E5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FdpsQ920E5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
FdpsQ920E5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FdpsQ920E5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FdpsQ920E5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FdpsQ920E5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FdpsQ920E5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FdpsQ920E5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FdpsQ920E5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FdpsQ920E5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FdpsQ920E5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FdpsQ920E5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FdpsQ920E5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
FdpsQ920E5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FdpsQ920E5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FdpsQ920E5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FdpsQ920E5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FdpsQ920E5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FdpsQ920E5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FdpsQ920E5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FdpsQ920E5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FdpsQ920E5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FdpsQ920E5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FdpsQ920E5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FdpsQ920E5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FdpsQ920E5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FdpsQ920E5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FdpsQ920E5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FdpsQ920E5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FdpsQ920E5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FdpsQ920E5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FdpsQ920E5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FdpsQ920E5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FdpsQ920E5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FdpsQ920E5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FdpsQ920E5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
FdpsQ920E5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FdpsQ920E5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FdpsQ920E5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FdpsQ920E5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FdpsQ920E5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FdpsQ920E5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FdpsQ920E5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FdpsQ920E5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FdpsQ920E5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FdpsQ920E5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FdpsQ920E5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FdpsQ920E5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FdpsQ920E5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FdpsQ920E5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FdpsQ920E5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FdpsQ920E5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FdpsQ920E5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FdpsQ920E5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FdpsQ920E5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
FdpsQ920E5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FdpsQ920E5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FdpsQ920E5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FdpsQ920E5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FdpsQ920E5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FdpsQ920E5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FdpsQ920E5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FdpsQ920E5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FdpsQ920E5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FdpsQ920E5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FdpsQ920E5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FdpsQ920E5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FdpsQ920E5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FdpsQ920E5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FdpsQ920E5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FdpsQ920E5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FdpsQ920E5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FdpsQ920E5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FdpsQ920E5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FdpsQ920E5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FdpsQ920E5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FdpsQ920E5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FdpsQ920E5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FdpsQ920E5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FdpsQ920E5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FdpsQ920E5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FdpsQ920E5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FdpsQ920E5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FdpsQ920E5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms