Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZU9

Grin3b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin3bQ91ZU9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,1■■□□□ 1,77
Grin3bQ91ZU9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,09■■□□□ 1,77
Grin3bQ91ZU9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,09■■□□□ 1,77
Grin3bQ91ZU9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,09■■□□□ 1,77
Grin3bQ91ZU9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,08■■□□□ 1,77
Grin3bQ91ZU9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26,08■■□□□ 1,77
Grin3bQ91ZU9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26,08■■□□□ 1,77
Grin3bQ91ZU9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,08■■□□□ 1,77
Grin3bQ91ZU9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26,08■■□□□ 1,77
Grin3bQ91ZU9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26,07■■□□□ 1,76
Grin3bQ91ZU9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,07■■□□□ 1,76
Grin3bQ91ZU9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,07■■□□□ 1,76
Grin3bQ91ZU9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26,06■■□□□ 1,76
Grin3bQ91ZU9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,06■■□□□ 1,76
Grin3bQ91ZU9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26,06■■□□□ 1,76
Grin3bQ91ZU9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,05■■□□□ 1,76
Grin3bQ91ZU9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26,05■■□□□ 1,76
Grin3bQ91ZU9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26,05■■□□□ 1,76
Grin3bQ91ZU9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,05■■□□□ 1,76
Grin3bQ91ZU9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26,04■■□□□ 1,76
Grin3bQ91ZU9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,04■■□□□ 1,76
Grin3bQ91ZU9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26,04■■□□□ 1,76
Grin3bQ91ZU9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26,03■■□□□ 1,76
Grin3bQ91ZU9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,03■■□□□ 1,76
Grin3bQ91ZU9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26,03■■□□□ 1,76
Grin3bQ91ZU9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26,03■■□□□ 1,76
Grin3bQ91ZU9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,03■■□□□ 1,76
Grin3bQ91ZU9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,03■■□□□ 1,76
Grin3bQ91ZU9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,03■■□□□ 1,76
Grin3bQ91ZU9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
Grin3bQ91ZU9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26,02■■□□□ 1,76
Grin3bQ91ZU9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
Grin3bQ91ZU9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
Grin3bQ91ZU9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,01■■□□□ 1,75
Grin3bQ91ZU9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1,75
Grin3bQ91ZU9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25,99■■□□□ 1,75
Grin3bQ91ZU9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,99■■□□□ 1,75
Grin3bQ91ZU9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,99■■□□□ 1,75
Grin3bQ91ZU9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,99■■□□□ 1,75
Grin3bQ91ZU9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,99■■□□□ 1,75
Grin3bQ91ZU9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,98■■□□□ 1,75
Grin3bQ91ZU9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25,98■■□□□ 1,75
Grin3bQ91ZU9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,97■■□□□ 1,75
Grin3bQ91ZU9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,97■■□□□ 1,75
Grin3bQ91ZU9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,97■■□□□ 1,75
Grin3bQ91ZU9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,97■■□□□ 1,75
Grin3bQ91ZU9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,95■■□□□ 1,75
Grin3bQ91ZU9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,95■■□□□ 1,74
Grin3bQ91ZU9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25,95■■□□□ 1,74
Grin3bQ91ZU9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
Grin3bQ91ZU9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25,94■■□□□ 1,74
Grin3bQ91ZU9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
Grin3bQ91ZU9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
Grin3bQ91ZU9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25,93■■□□□ 1,74
Grin3bQ91ZU9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
Grin3bQ91ZU9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
Grin3bQ91ZU9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25,91■■□□□ 1,74
Grin3bQ91ZU9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
Grin3bQ91ZU9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
Grin3bQ91ZU9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,9■■□□□ 1,74
Grin3bQ91ZU9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,9■■□□□ 1,74
Grin3bQ91ZU9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25,9■■□□□ 1,74
Grin3bQ91ZU9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25,9■■□□□ 1,74
Grin3bQ91ZU9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,89■■□□□ 1,74
Grin3bQ91ZU9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25,89■■□□□ 1,74
Grin3bQ91ZU9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,89■■□□□ 1,74
Grin3bQ91ZU9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25,89■■□□□ 1,73
Grin3bQ91ZU9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25,89■■□□□ 1,73
Grin3bQ91ZU9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25,88■■□□□ 1,73
Grin3bQ91ZU9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
Grin3bQ91ZU9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
Grin3bQ91ZU9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
Grin3bQ91ZU9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
Grin3bQ91ZU9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Grin3bQ91ZU9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Grin3bQ91ZU9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
Grin3bQ91ZU9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
Grin3bQ91ZU9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25,85■■□□□ 1,73
Grin3bQ91ZU9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25,85■■□□□ 1,73
Grin3bQ91ZU9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25,85■■□□□ 1,73
Grin3bQ91ZU9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25,85■■□□□ 1,73
Grin3bQ91ZU9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
Grin3bQ91ZU9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25,85■■□□□ 1,73
Grin3bQ91ZU9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25,85■■□□□ 1,73
Grin3bQ91ZU9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Grin3bQ91ZU9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,84■■□□□ 1,73
Grin3bQ91ZU9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,84■■□□□ 1,73
Grin3bQ91ZU9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25,84■■□□□ 1,73
Grin3bQ91ZU9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Grin3bQ91ZU9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Grin3bQ91ZU9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25,84■■□□□ 1,73
Grin3bQ91ZU9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,83■■□□□ 1,73
Grin3bQ91ZU9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,73
Grin3bQ91ZU9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,73
Grin3bQ91ZU9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,73
Grin3bQ91ZU9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,72
Grin3bQ91ZU9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
Grin3bQ91ZU9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
Grin3bQ91ZU9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
Grin3bQ91ZU9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,82■■□□□ 1,72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18,4 ms