Protein–RNA interactions for Protein: Q91VM4

Spns2, Protein spinster homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns2Q91VM4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Spns2Q91VM4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Spns2Q91VM4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Spns2Q91VM4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Spns2Q91VM4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Spns2Q91VM4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Spns2Q91VM4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Spns2Q91VM4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Spns2Q91VM4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Spns2Q91VM4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Spns2Q91VM4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Spns2Q91VM4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Spns2Q91VM4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Spns2Q91VM4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Spns2Q91VM4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Spns2Q91VM4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Spns2Q91VM4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Spns2Q91VM4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Spns2Q91VM4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Spns2Q91VM4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Spns2Q91VM4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Spns2Q91VM4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Spns2Q91VM4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Spns2Q91VM4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Spns2Q91VM4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Spns2Q91VM4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Spns2Q91VM4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Spns2Q91VM4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Spns2Q91VM4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Spns2Q91VM4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Spns2Q91VM4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Spns2Q91VM4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Spns2Q91VM4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Spns2Q91VM4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Spns2Q91VM4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Spns2Q91VM4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Spns2Q91VM4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Spns2Q91VM4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Spns2Q91VM4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Spns2Q91VM4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Spns2Q91VM4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Spns2Q91VM4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Spns2Q91VM4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Spns2Q91VM4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Spns2Q91VM4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Spns2Q91VM4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Spns2Q91VM4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Spns2Q91VM4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Spns2Q91VM4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Spns2Q91VM4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Spns2Q91VM4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Spns2Q91VM4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Spns2Q91VM4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Spns2Q91VM4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Spns2Q91VM4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Spns2Q91VM4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Spns2Q91VM4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Spns2Q91VM4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Spns2Q91VM4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Spns2Q91VM4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Spns2Q91VM4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Spns2Q91VM4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Spns2Q91VM4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Spns2Q91VM4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Spns2Q91VM4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Spns2Q91VM4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Spns2Q91VM4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Spns2Q91VM4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Spns2Q91VM4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Spns2Q91VM4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Spns2Q91VM4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Spns2Q91VM4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Spns2Q91VM4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Spns2Q91VM4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Spns2Q91VM4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Spns2Q91VM4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Spns2Q91VM4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Spns2Q91VM4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Spns2Q91VM4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Spns2Q91VM4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Spns2Q91VM4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Spns2Q91VM4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Spns2Q91VM4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Spns2Q91VM4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Spns2Q91VM4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Spns2Q91VM4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Spns2Q91VM4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Spns2Q91VM4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Spns2Q91VM4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Spns2Q91VM4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Spns2Q91VM4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Spns2Q91VM4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Spns2Q91VM4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Spns2Q91VM4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Spns2Q91VM4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Spns2Q91VM4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Spns2Q91VM4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Spns2Q91VM4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Spns2Q91VM4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Spns2Q91VM4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms