Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHK1

Caskin2, Caskin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caskin2Q8VHK1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Caskin2Q8VHK1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Caskin2Q8VHK1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Caskin2Q8VHK1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Caskin2Q8VHK1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Caskin2Q8VHK1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Caskin2Q8VHK1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Caskin2Q8VHK1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Caskin2Q8VHK1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Caskin2Q8VHK1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Caskin2Q8VHK1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Caskin2Q8VHK1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Caskin2Q8VHK1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Caskin2Q8VHK1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Caskin2Q8VHK1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Caskin2Q8VHK1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Caskin2Q8VHK1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Caskin2Q8VHK1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Caskin2Q8VHK1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Caskin2Q8VHK1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Caskin2Q8VHK1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Caskin2Q8VHK1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Caskin2Q8VHK1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Caskin2Q8VHK1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Caskin2Q8VHK1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Caskin2Q8VHK1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Caskin2Q8VHK1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Caskin2Q8VHK1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Caskin2Q8VHK1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Caskin2Q8VHK1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Caskin2Q8VHK1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Caskin2Q8VHK1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Caskin2Q8VHK1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Caskin2Q8VHK1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Caskin2Q8VHK1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Caskin2Q8VHK1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Caskin2Q8VHK1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Caskin2Q8VHK1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Caskin2Q8VHK1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Caskin2Q8VHK1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Caskin2Q8VHK1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Caskin2Q8VHK1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Caskin2Q8VHK1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Caskin2Q8VHK1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Caskin2Q8VHK1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Caskin2Q8VHK1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Caskin2Q8VHK1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Caskin2Q8VHK1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Caskin2Q8VHK1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Caskin2Q8VHK1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Caskin2Q8VHK1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Caskin2Q8VHK1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Caskin2Q8VHK1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Caskin2Q8VHK1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Caskin2Q8VHK1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Caskin2Q8VHK1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Caskin2Q8VHK1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Caskin2Q8VHK1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Caskin2Q8VHK1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Caskin2Q8VHK1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Caskin2Q8VHK1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Caskin2Q8VHK1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Caskin2Q8VHK1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Caskin2Q8VHK1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Caskin2Q8VHK1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Caskin2Q8VHK1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Caskin2Q8VHK1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Caskin2Q8VHK1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Caskin2Q8VHK1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Caskin2Q8VHK1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Caskin2Q8VHK1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Caskin2Q8VHK1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Caskin2Q8VHK1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Caskin2Q8VHK1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Caskin2Q8VHK1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Caskin2Q8VHK1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Caskin2Q8VHK1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Caskin2Q8VHK1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Caskin2Q8VHK1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Caskin2Q8VHK1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Caskin2Q8VHK1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Caskin2Q8VHK1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Caskin2Q8VHK1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Caskin2Q8VHK1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Caskin2Q8VHK1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Caskin2Q8VHK1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Caskin2Q8VHK1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Caskin2Q8VHK1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Caskin2Q8VHK1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Caskin2Q8VHK1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Caskin2Q8VHK1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Caskin2Q8VHK1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Caskin2Q8VHK1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Caskin2Q8VHK1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Caskin2Q8VHK1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Caskin2Q8VHK1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Caskin2Q8VHK1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Caskin2Q8VHK1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Caskin2Q8VHK1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Caskin2Q8VHK1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms