Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDR7

Tgds, dTDP-D-glucose 4,6-dehydratase, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgdsQ8VDR7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TgdsQ8VDR7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TgdsQ8VDR7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TgdsQ8VDR7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TgdsQ8VDR7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TgdsQ8VDR7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TgdsQ8VDR7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TgdsQ8VDR7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TgdsQ8VDR7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TgdsQ8VDR7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TgdsQ8VDR7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TgdsQ8VDR7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TgdsQ8VDR7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TgdsQ8VDR7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TgdsQ8VDR7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TgdsQ8VDR7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TgdsQ8VDR7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TgdsQ8VDR7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TgdsQ8VDR7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TgdsQ8VDR7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TgdsQ8VDR7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TgdsQ8VDR7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TgdsQ8VDR7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TgdsQ8VDR7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TgdsQ8VDR7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TgdsQ8VDR7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TgdsQ8VDR7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TgdsQ8VDR7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TgdsQ8VDR7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TgdsQ8VDR7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TgdsQ8VDR7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TgdsQ8VDR7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TgdsQ8VDR7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TgdsQ8VDR7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TgdsQ8VDR7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TgdsQ8VDR7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TgdsQ8VDR7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TgdsQ8VDR7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TgdsQ8VDR7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TgdsQ8VDR7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TgdsQ8VDR7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TgdsQ8VDR7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TgdsQ8VDR7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TgdsQ8VDR7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TgdsQ8VDR7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TgdsQ8VDR7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TgdsQ8VDR7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TgdsQ8VDR7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TgdsQ8VDR7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TgdsQ8VDR7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TgdsQ8VDR7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TgdsQ8VDR7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TgdsQ8VDR7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TgdsQ8VDR7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TgdsQ8VDR7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TgdsQ8VDR7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TgdsQ8VDR7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TgdsQ8VDR7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TgdsQ8VDR7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TgdsQ8VDR7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TgdsQ8VDR7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TgdsQ8VDR7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TgdsQ8VDR7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TgdsQ8VDR7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TgdsQ8VDR7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TgdsQ8VDR7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TgdsQ8VDR7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TgdsQ8VDR7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TgdsQ8VDR7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TgdsQ8VDR7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TgdsQ8VDR7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TgdsQ8VDR7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TgdsQ8VDR7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TgdsQ8VDR7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TgdsQ8VDR7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TgdsQ8VDR7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TgdsQ8VDR7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TgdsQ8VDR7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TgdsQ8VDR7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TgdsQ8VDR7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TgdsQ8VDR7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TgdsQ8VDR7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TgdsQ8VDR7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TgdsQ8VDR7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TgdsQ8VDR7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TgdsQ8VDR7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TgdsQ8VDR7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TgdsQ8VDR7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TgdsQ8VDR7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TgdsQ8VDR7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TgdsQ8VDR7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TgdsQ8VDR7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TgdsQ8VDR7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TgdsQ8VDR7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TgdsQ8VDR7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TgdsQ8VDR7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TgdsQ8VDR7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TgdsQ8VDR7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TgdsQ8VDR7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TgdsQ8VDR7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms