Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDN4

Ccdc92, Coiled-coil domain-containing protein 92, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc92Q8VDN4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc92Q8VDN4 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc92Q8VDN4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc92Q8VDN4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc92Q8VDN4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc92Q8VDN4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc92Q8VDN4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc92Q8VDN4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc92Q8VDN4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc92Q8VDN4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc92Q8VDN4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc92Q8VDN4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc92Q8VDN4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc92Q8VDN4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc92Q8VDN4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc92Q8VDN4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc92Q8VDN4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc92Q8VDN4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc92Q8VDN4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc92Q8VDN4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc92Q8VDN4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc92Q8VDN4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc92Q8VDN4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc92Q8VDN4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc92Q8VDN4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc92Q8VDN4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc92Q8VDN4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc92Q8VDN4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc92Q8VDN4 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc92Q8VDN4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc92Q8VDN4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc92Q8VDN4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc92Q8VDN4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc92Q8VDN4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc92Q8VDN4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc92Q8VDN4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc92Q8VDN4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc92Q8VDN4 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc92Q8VDN4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc92Q8VDN4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc92Q8VDN4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc92Q8VDN4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc92Q8VDN4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc92Q8VDN4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc92Q8VDN4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc92Q8VDN4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc92Q8VDN4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc92Q8VDN4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc92Q8VDN4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc92Q8VDN4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc92Q8VDN4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc92Q8VDN4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc92Q8VDN4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc92Q8VDN4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc92Q8VDN4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc92Q8VDN4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc92Q8VDN4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc92Q8VDN4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc92Q8VDN4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc92Q8VDN4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc92Q8VDN4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc92Q8VDN4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc92Q8VDN4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc92Q8VDN4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc92Q8VDN4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc92Q8VDN4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc92Q8VDN4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc92Q8VDN4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc92Q8VDN4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc92Q8VDN4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc92Q8VDN4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc92Q8VDN4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc92Q8VDN4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc92Q8VDN4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc92Q8VDN4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc92Q8VDN4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc92Q8VDN4 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc92Q8VDN4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc92Q8VDN4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc92Q8VDN4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc92Q8VDN4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc92Q8VDN4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc92Q8VDN4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc92Q8VDN4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc92Q8VDN4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc92Q8VDN4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc92Q8VDN4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc92Q8VDN4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc92Q8VDN4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc92Q8VDN4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc92Q8VDN4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc92Q8VDN4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc92Q8VDN4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ccdc92Q8VDN4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc92Q8VDN4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc92Q8VDN4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc92Q8VDN4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc92Q8VDN4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc92Q8VDN4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc92Q8VDN4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms