Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDF2

Uhrf1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1Q8VDF2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Uhrf1Q8VDF2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Uhrf1Q8VDF2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Uhrf1Q8VDF2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Uhrf1Q8VDF2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Uhrf1Q8VDF2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Uhrf1Q8VDF2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Uhrf1Q8VDF2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Uhrf1Q8VDF2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Uhrf1Q8VDF2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Uhrf1Q8VDF2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Uhrf1Q8VDF2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Uhrf1Q8VDF2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Uhrf1Q8VDF2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Uhrf1Q8VDF2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Uhrf1Q8VDF2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Uhrf1Q8VDF2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Uhrf1Q8VDF2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Uhrf1Q8VDF2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Uhrf1Q8VDF2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Uhrf1Q8VDF2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Uhrf1Q8VDF2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Uhrf1Q8VDF2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Uhrf1Q8VDF2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Uhrf1Q8VDF2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Uhrf1Q8VDF2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Uhrf1Q8VDF2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Uhrf1Q8VDF2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Uhrf1Q8VDF2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Uhrf1Q8VDF2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Uhrf1Q8VDF2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Uhrf1Q8VDF2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Uhrf1Q8VDF2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Uhrf1Q8VDF2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Uhrf1Q8VDF2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Uhrf1Q8VDF2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Uhrf1Q8VDF2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Uhrf1Q8VDF2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Uhrf1Q8VDF2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Uhrf1Q8VDF2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Uhrf1Q8VDF2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Uhrf1Q8VDF2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Uhrf1Q8VDF2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Uhrf1Q8VDF2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Uhrf1Q8VDF2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Uhrf1Q8VDF2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Uhrf1Q8VDF2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Uhrf1Q8VDF2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Uhrf1Q8VDF2 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Uhrf1Q8VDF2 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Uhrf1Q8VDF2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Uhrf1Q8VDF2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Uhrf1Q8VDF2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Uhrf1Q8VDF2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Uhrf1Q8VDF2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Uhrf1Q8VDF2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Uhrf1Q8VDF2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Uhrf1Q8VDF2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Uhrf1Q8VDF2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Uhrf1Q8VDF2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Uhrf1Q8VDF2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Uhrf1Q8VDF2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Uhrf1Q8VDF2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Uhrf1Q8VDF2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Uhrf1Q8VDF2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Uhrf1Q8VDF2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Uhrf1Q8VDF2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Uhrf1Q8VDF2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Uhrf1Q8VDF2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Uhrf1Q8VDF2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Uhrf1Q8VDF2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Uhrf1Q8VDF2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Uhrf1Q8VDF2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Uhrf1Q8VDF2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Uhrf1Q8VDF2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Uhrf1Q8VDF2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Uhrf1Q8VDF2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Uhrf1Q8VDF2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Uhrf1Q8VDF2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Uhrf1Q8VDF2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Uhrf1Q8VDF2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Uhrf1Q8VDF2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Uhrf1Q8VDF2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Uhrf1Q8VDF2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Uhrf1Q8VDF2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Uhrf1Q8VDF2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Uhrf1Q8VDF2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Uhrf1Q8VDF2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Uhrf1Q8VDF2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Uhrf1Q8VDF2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Uhrf1Q8VDF2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Uhrf1Q8VDF2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Uhrf1Q8VDF2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Uhrf1Q8VDF2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Uhrf1Q8VDF2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Uhrf1Q8VDF2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Uhrf1Q8VDF2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Uhrf1Q8VDF2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Uhrf1Q8VDF2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Uhrf1Q8VDF2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms