Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4F0

Mcoln3, Mucolipin-3, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcoln3Q8R4F0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mcoln3Q8R4F0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mcoln3Q8R4F0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mcoln3Q8R4F0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mcoln3Q8R4F0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mcoln3Q8R4F0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mcoln3Q8R4F0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mcoln3Q8R4F0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mcoln3Q8R4F0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mcoln3Q8R4F0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mcoln3Q8R4F0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mcoln3Q8R4F0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mcoln3Q8R4F0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mcoln3Q8R4F0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mcoln3Q8R4F0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mcoln3Q8R4F0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mcoln3Q8R4F0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mcoln3Q8R4F0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mcoln3Q8R4F0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mcoln3Q8R4F0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mcoln3Q8R4F0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mcoln3Q8R4F0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Mcoln3Q8R4F0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mcoln3Q8R4F0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mcoln3Q8R4F0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mcoln3Q8R4F0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mcoln3Q8R4F0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mcoln3Q8R4F0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mcoln3Q8R4F0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mcoln3Q8R4F0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mcoln3Q8R4F0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mcoln3Q8R4F0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mcoln3Q8R4F0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mcoln3Q8R4F0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mcoln3Q8R4F0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mcoln3Q8R4F0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mcoln3Q8R4F0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mcoln3Q8R4F0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mcoln3Q8R4F0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mcoln3Q8R4F0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Mcoln3Q8R4F0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mcoln3Q8R4F0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mcoln3Q8R4F0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mcoln3Q8R4F0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mcoln3Q8R4F0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mcoln3Q8R4F0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mcoln3Q8R4F0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mcoln3Q8R4F0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mcoln3Q8R4F0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mcoln3Q8R4F0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mcoln3Q8R4F0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mcoln3Q8R4F0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mcoln3Q8R4F0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mcoln3Q8R4F0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mcoln3Q8R4F0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mcoln3Q8R4F0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mcoln3Q8R4F0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mcoln3Q8R4F0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mcoln3Q8R4F0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mcoln3Q8R4F0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mcoln3Q8R4F0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mcoln3Q8R4F0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mcoln3Q8R4F0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mcoln3Q8R4F0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mcoln3Q8R4F0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mcoln3Q8R4F0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mcoln3Q8R4F0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mcoln3Q8R4F0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Mcoln3Q8R4F0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mcoln3Q8R4F0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mcoln3Q8R4F0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mcoln3Q8R4F0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mcoln3Q8R4F0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mcoln3Q8R4F0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mcoln3Q8R4F0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mcoln3Q8R4F0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mcoln3Q8R4F0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mcoln3Q8R4F0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mcoln3Q8R4F0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Mcoln3Q8R4F0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mcoln3Q8R4F0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mcoln3Q8R4F0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mcoln3Q8R4F0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mcoln3Q8R4F0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mcoln3Q8R4F0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mcoln3Q8R4F0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mcoln3Q8R4F0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mcoln3Q8R4F0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mcoln3Q8R4F0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mcoln3Q8R4F0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mcoln3Q8R4F0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mcoln3Q8R4F0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mcoln3Q8R4F0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mcoln3Q8R4F0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mcoln3Q8R4F0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mcoln3Q8R4F0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mcoln3Q8R4F0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mcoln3Q8R4F0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mcoln3Q8R4F0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mcoln3Q8R4F0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms