Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4C2

Rufy2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy2Q8R4C2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Rufy2Q8R4C2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27,17■■□□□ 1,94
Rufy2Q8R4C2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,17■■□□□ 1,94
Rufy2Q8R4C2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Rufy2Q8R4C2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
Rufy2Q8R4C2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
Rufy2Q8R4C2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
Rufy2Q8R4C2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
Rufy2Q8R4C2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
Rufy2Q8R4C2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
Rufy2Q8R4C2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,94
Rufy2Q8R4C2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,94
Rufy2Q8R4C2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,93
Rufy2Q8R4C2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,93
Rufy2Q8R4C2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
Rufy2Q8R4C2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
Rufy2Q8R4C2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
Rufy2Q8R4C2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,13■■□□□ 1,93
Rufy2Q8R4C2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
Rufy2Q8R4C2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
Rufy2Q8R4C2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
Rufy2Q8R4C2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
Rufy2Q8R4C2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
Rufy2Q8R4C2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
Rufy2Q8R4C2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27,11■■□□□ 1,93
Rufy2Q8R4C2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
Rufy2Q8R4C2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Rufy2Q8R4C2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Rufy2Q8R4C2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Rufy2Q8R4C2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27,09■■□□□ 1,93
Rufy2Q8R4C2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27,09■■□□□ 1,93
Rufy2Q8R4C2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
Rufy2Q8R4C2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27,08■■□□□ 1,93
Rufy2Q8R4C2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
Rufy2Q8R4C2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Rufy2Q8R4C2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,06■■□□□ 1,92
Rufy2Q8R4C2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
Rufy2Q8R4C2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
Rufy2Q8R4C2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27,06■■□□□ 1,92
Rufy2Q8R4C2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,05■■□□□ 1,92
Rufy2Q8R4C2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27,05■■□□□ 1,92
Rufy2Q8R4C2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,05■■□□□ 1,92
Rufy2Q8R4C2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27,05■■□□□ 1,92
Rufy2Q8R4C2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
Rufy2Q8R4C2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27,03■■□□□ 1,92
Rufy2Q8R4C2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Rufy2Q8R4C2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Rufy2Q8R4C2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Rufy2Q8R4C2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Rufy2Q8R4C2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
Rufy2Q8R4C2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
Rufy2Q8R4C2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
Rufy2Q8R4C2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
Rufy2Q8R4C2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Rufy2Q8R4C2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Rufy2Q8R4C2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26,99■■□□□ 1,91
Rufy2Q8R4C2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26,99■■□□□ 1,91
Rufy2Q8R4C2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,99■■□□□ 1,91
Rufy2Q8R4C2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26,99■■□□□ 1,91
Rufy2Q8R4C2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
Rufy2Q8R4C2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Rufy2Q8R4C2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,97■■□□□ 1,91
Rufy2Q8R4C2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Rufy2Q8R4C2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Rufy2Q8R4C2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,96■■□□□ 1,91
Rufy2Q8R4C2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,9
Rufy2Q8R4C2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,9
Rufy2Q8R4C2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,9
Rufy2Q8R4C2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,9
Rufy2Q8R4C2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Rufy2Q8R4C2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Rufy2Q8R4C2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26,94■■□□□ 1,9
Rufy2Q8R4C2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Rufy2Q8R4C2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Rufy2Q8R4C2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Rufy2Q8R4C2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
Rufy2Q8R4C2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
Rufy2Q8R4C2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
Rufy2Q8R4C2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
Rufy2Q8R4C2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
Rufy2Q8R4C2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
Rufy2Q8R4C2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
Rufy2Q8R4C2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,9
Rufy2Q8R4C2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26,88■■□□□ 1,89
Rufy2Q8R4C2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
Rufy2Q8R4C2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26,87■■□□□ 1,89
Rufy2Q8R4C2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
Rufy2Q8R4C2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26,86■■□□□ 1,89
Rufy2Q8R4C2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26,86■■□□□ 1,89
Rufy2Q8R4C2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
Rufy2Q8R4C2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
Rufy2Q8R4C2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
Rufy2Q8R4C2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
Rufy2Q8R4C2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
Rufy2Q8R4C2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
Rufy2Q8R4C2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
Rufy2Q8R4C2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
Rufy2Q8R4C2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
Rufy2Q8R4C2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26,84■■□□□ 1,89
Rufy2Q8R4C2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26,84■■□□□ 1,89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,4 ms