Protein–RNA interactions for Protein: Q8R361

Rab11fip5, Rab11 family-interacting protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip5Q8R361 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rab11fip5Q8R361 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rab11fip5Q8R361 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rab11fip5Q8R361 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rab11fip5Q8R361 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Rab11fip5Q8R361 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rab11fip5Q8R361 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rab11fip5Q8R361 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rab11fip5Q8R361 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rab11fip5Q8R361 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rab11fip5Q8R361 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rab11fip5Q8R361 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rab11fip5Q8R361 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rab11fip5Q8R361 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rab11fip5Q8R361 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rab11fip5Q8R361 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rab11fip5Q8R361 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab11fip5Q8R361 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab11fip5Q8R361 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab11fip5Q8R361 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab11fip5Q8R361 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab11fip5Q8R361 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rab11fip5Q8R361 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab11fip5Q8R361 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rab11fip5Q8R361 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rab11fip5Q8R361 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rab11fip5Q8R361 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rab11fip5Q8R361 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rab11fip5Q8R361 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rab11fip5Q8R361 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rab11fip5Q8R361 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Rab11fip5Q8R361 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rab11fip5Q8R361 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rab11fip5Q8R361 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rab11fip5Q8R361 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rab11fip5Q8R361 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rab11fip5Q8R361 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rab11fip5Q8R361 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rab11fip5Q8R361 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rab11fip5Q8R361 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rab11fip5Q8R361 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rab11fip5Q8R361 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Rab11fip5Q8R361 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rab11fip5Q8R361 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rab11fip5Q8R361 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rab11fip5Q8R361 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rab11fip5Q8R361 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rab11fip5Q8R361 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rab11fip5Q8R361 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Rab11fip5Q8R361 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rab11fip5Q8R361 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Rab11fip5Q8R361 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rab11fip5Q8R361 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rab11fip5Q8R361 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab11fip5Q8R361 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab11fip5Q8R361 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab11fip5Q8R361 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab11fip5Q8R361 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab11fip5Q8R361 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab11fip5Q8R361 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab11fip5Q8R361 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab11fip5Q8R361 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rab11fip5Q8R361 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rab11fip5Q8R361 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rab11fip5Q8R361 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rab11fip5Q8R361 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Rab11fip5Q8R361 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rab11fip5Q8R361 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rab11fip5Q8R361 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rab11fip5Q8R361 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rab11fip5Q8R361 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rab11fip5Q8R361 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rab11fip5Q8R361 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rab11fip5Q8R361 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rab11fip5Q8R361 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rab11fip5Q8R361 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rab11fip5Q8R361 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab11fip5Q8R361 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab11fip5Q8R361 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab11fip5Q8R361 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rab11fip5Q8R361 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rab11fip5Q8R361 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rab11fip5Q8R361 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rab11fip5Q8R361 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rab11fip5Q8R361 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rab11fip5Q8R361 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rab11fip5Q8R361 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rab11fip5Q8R361 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rab11fip5Q8R361 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rab11fip5Q8R361 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rab11fip5Q8R361 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rab11fip5Q8R361 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rab11fip5Q8R361 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rab11fip5Q8R361 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab11fip5Q8R361 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab11fip5Q8R361 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab11fip5Q8R361 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab11fip5Q8R361 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab11fip5Q8R361 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rab11fip5Q8R361 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms