Protein–RNA interactions for Protein: Q8R349

Cdc16, Cell division cycle protein 16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc16Q8R349 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cdc16Q8R349 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdc16Q8R349 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdc16Q8R349 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cdc16Q8R349 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdc16Q8R349 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdc16Q8R349 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdc16Q8R349 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdc16Q8R349 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cdc16Q8R349 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdc16Q8R349 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdc16Q8R349 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cdc16Q8R349 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdc16Q8R349 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdc16Q8R349 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdc16Q8R349 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdc16Q8R349 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cdc16Q8R349 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdc16Q8R349 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdc16Q8R349 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cdc16Q8R349 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cdc16Q8R349 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cdc16Q8R349 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdc16Q8R349 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cdc16Q8R349 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdc16Q8R349 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdc16Q8R349 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdc16Q8R349 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cdc16Q8R349 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdc16Q8R349 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdc16Q8R349 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdc16Q8R349 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdc16Q8R349 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdc16Q8R349 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdc16Q8R349 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cdc16Q8R349 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdc16Q8R349 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdc16Q8R349 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdc16Q8R349 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdc16Q8R349 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cdc16Q8R349 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cdc16Q8R349 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cdc16Q8R349 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cdc16Q8R349 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cdc16Q8R349 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdc16Q8R349 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdc16Q8R349 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cdc16Q8R349 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdc16Q8R349 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cdc16Q8R349 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdc16Q8R349 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cdc16Q8R349 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdc16Q8R349 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdc16Q8R349 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cdc16Q8R349 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdc16Q8R349 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cdc16Q8R349 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdc16Q8R349 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdc16Q8R349 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdc16Q8R349 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cdc16Q8R349 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdc16Q8R349 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdc16Q8R349 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdc16Q8R349 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cdc16Q8R349 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdc16Q8R349 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdc16Q8R349 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdc16Q8R349 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdc16Q8R349 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdc16Q8R349 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cdc16Q8R349 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdc16Q8R349 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdc16Q8R349 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdc16Q8R349 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cdc16Q8R349 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdc16Q8R349 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Cdc16Q8R349 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cdc16Q8R349 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdc16Q8R349 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdc16Q8R349 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdc16Q8R349 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdc16Q8R349 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cdc16Q8R349 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cdc16Q8R349 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdc16Q8R349 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdc16Q8R349 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cdc16Q8R349 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdc16Q8R349 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdc16Q8R349 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdc16Q8R349 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdc16Q8R349 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cdc16Q8R349 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdc16Q8R349 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdc16Q8R349 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdc16Q8R349 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdc16Q8R349 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdc16Q8R349 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdc16Q8R349 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cdc16Q8R349 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cdc16Q8R349 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms