Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q3

Zfp940, Zinc finger protein 940, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp940Q8R2Q3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zfp940Q8R2Q3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zfp940Q8R2Q3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zfp940Q8R2Q3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zfp940Q8R2Q3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Zfp940Q8R2Q3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zfp940Q8R2Q3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zfp940Q8R2Q3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Zfp940Q8R2Q3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zfp940Q8R2Q3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zfp940Q8R2Q3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Zfp940Q8R2Q3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zfp940Q8R2Q3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zfp940Q8R2Q3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Zfp940Q8R2Q3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zfp940Q8R2Q3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zfp940Q8R2Q3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zfp940Q8R2Q3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zfp940Q8R2Q3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Zfp940Q8R2Q3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zfp940Q8R2Q3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zfp940Q8R2Q3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zfp940Q8R2Q3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Zfp940Q8R2Q3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zfp940Q8R2Q3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zfp940Q8R2Q3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Zfp940Q8R2Q3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zfp940Q8R2Q3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Zfp940Q8R2Q3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zfp940Q8R2Q3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zfp940Q8R2Q3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zfp940Q8R2Q3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Zfp940Q8R2Q3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zfp940Q8R2Q3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zfp940Q8R2Q3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Zfp940Q8R2Q3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zfp940Q8R2Q3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Zfp940Q8R2Q3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zfp940Q8R2Q3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Zfp940Q8R2Q3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zfp940Q8R2Q3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Zfp940Q8R2Q3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Zfp940Q8R2Q3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zfp940Q8R2Q3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zfp940Q8R2Q3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Zfp940Q8R2Q3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zfp940Q8R2Q3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Zfp940Q8R2Q3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfp940Q8R2Q3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfp940Q8R2Q3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Zfp940Q8R2Q3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp940Q8R2Q3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp940Q8R2Q3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Zfp940Q8R2Q3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfp940Q8R2Q3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfp940Q8R2Q3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfp940Q8R2Q3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zfp940Q8R2Q3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Zfp940Q8R2Q3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zfp940Q8R2Q3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zfp940Q8R2Q3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zfp940Q8R2Q3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zfp940Q8R2Q3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zfp940Q8R2Q3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zfp940Q8R2Q3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zfp940Q8R2Q3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zfp940Q8R2Q3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfp940Q8R2Q3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfp940Q8R2Q3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zfp940Q8R2Q3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zfp940Q8R2Q3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zfp940Q8R2Q3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zfp940Q8R2Q3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zfp940Q8R2Q3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zfp940Q8R2Q3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zfp940Q8R2Q3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zfp940Q8R2Q3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zfp940Q8R2Q3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zfp940Q8R2Q3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zfp940Q8R2Q3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Zfp940Q8R2Q3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zfp940Q8R2Q3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zfp940Q8R2Q3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zfp940Q8R2Q3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zfp940Q8R2Q3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zfp940Q8R2Q3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zfp940Q8R2Q3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zfp940Q8R2Q3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zfp940Q8R2Q3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zfp940Q8R2Q3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zfp940Q8R2Q3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zfp940Q8R2Q3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zfp940Q8R2Q3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zfp940Q8R2Q3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zfp940Q8R2Q3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Zfp940Q8R2Q3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zfp940Q8R2Q3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zfp940Q8R2Q3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zfp940Q8R2Q3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zfp940Q8R2Q3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119 ms