Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q0

Trim29, Tripartite motif-containing protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim29Q8R2Q0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Trim29Q8R2Q0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.84
Trim29Q8R2Q0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trim29Q8R2Q0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trim29Q8R2Q0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trim29Q8R2Q0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trim29Q8R2Q0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trim29Q8R2Q0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trim29Q8R2Q0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trim29Q8R2Q0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Trim29Q8R2Q0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trim29Q8R2Q0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trim29Q8R2Q0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Trim29Q8R2Q0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Trim29Q8R2Q0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trim29Q8R2Q0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trim29Q8R2Q0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trim29Q8R2Q0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Trim29Q8R2Q0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trim29Q8R2Q0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trim29Q8R2Q0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trim29Q8R2Q0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trim29Q8R2Q0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trim29Q8R2Q0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trim29Q8R2Q0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trim29Q8R2Q0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trim29Q8R2Q0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trim29Q8R2Q0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trim29Q8R2Q0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Trim29Q8R2Q0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Trim29Q8R2Q0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Trim29Q8R2Q0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Trim29Q8R2Q0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Trim29Q8R2Q0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Trim29Q8R2Q0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Trim29Q8R2Q0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Trim29Q8R2Q0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Trim29Q8R2Q0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Trim29Q8R2Q0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trim29Q8R2Q0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trim29Q8R2Q0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trim29Q8R2Q0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trim29Q8R2Q0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trim29Q8R2Q0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trim29Q8R2Q0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trim29Q8R2Q0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trim29Q8R2Q0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Trim29Q8R2Q0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Trim29Q8R2Q0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Trim29Q8R2Q0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Trim29Q8R2Q0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Trim29Q8R2Q0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Trim29Q8R2Q0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trim29Q8R2Q0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trim29Q8R2Q0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trim29Q8R2Q0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trim29Q8R2Q0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Trim29Q8R2Q0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Trim29Q8R2Q0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trim29Q8R2Q0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trim29Q8R2Q0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trim29Q8R2Q0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trim29Q8R2Q0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trim29Q8R2Q0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trim29Q8R2Q0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trim29Q8R2Q0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trim29Q8R2Q0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trim29Q8R2Q0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trim29Q8R2Q0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trim29Q8R2Q0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trim29Q8R2Q0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trim29Q8R2Q0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trim29Q8R2Q0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Trim29Q8R2Q0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trim29Q8R2Q0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trim29Q8R2Q0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trim29Q8R2Q0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trim29Q8R2Q0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trim29Q8R2Q0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trim29Q8R2Q0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trim29Q8R2Q0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trim29Q8R2Q0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trim29Q8R2Q0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trim29Q8R2Q0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trim29Q8R2Q0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trim29Q8R2Q0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trim29Q8R2Q0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trim29Q8R2Q0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trim29Q8R2Q0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trim29Q8R2Q0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trim29Q8R2Q0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trim29Q8R2Q0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trim29Q8R2Q0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trim29Q8R2Q0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trim29Q8R2Q0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Trim29Q8R2Q0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trim29Q8R2Q0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trim29Q8R2Q0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Trim29Q8R2Q0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Trim29Q8R2Q0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms