Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0H9

Gga1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, mousemouse

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga1Q8R0H9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gga1Q8R0H9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gga1Q8R0H9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gga1Q8R0H9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gga1Q8R0H9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gga1Q8R0H9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gga1Q8R0H9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gga1Q8R0H9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gga1Q8R0H9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Gga1Q8R0H9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Gga1Q8R0H9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gga1Q8R0H9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gga1Q8R0H9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gga1Q8R0H9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gga1Q8R0H9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gga1Q8R0H9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gga1Q8R0H9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gga1Q8R0H9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gga1Q8R0H9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Gga1Q8R0H9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gga1Q8R0H9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gga1Q8R0H9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gga1Q8R0H9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gga1Q8R0H9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gga1Q8R0H9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gga1Q8R0H9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gga1Q8R0H9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Gga1Q8R0H9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gga1Q8R0H9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gga1Q8R0H9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gga1Q8R0H9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gga1Q8R0H9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gga1Q8R0H9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Gga1Q8R0H9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gga1Q8R0H9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gga1Q8R0H9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gga1Q8R0H9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gga1Q8R0H9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gga1Q8R0H9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gga1Q8R0H9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gga1Q8R0H9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gga1Q8R0H9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gga1Q8R0H9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gga1Q8R0H9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gga1Q8R0H9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gga1Q8R0H9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Gga1Q8R0H9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Gga1Q8R0H9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gga1Q8R0H9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gga1Q8R0H9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gga1Q8R0H9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gga1Q8R0H9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gga1Q8R0H9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gga1Q8R0H9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gga1Q8R0H9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gga1Q8R0H9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gga1Q8R0H9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gga1Q8R0H9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gga1Q8R0H9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gga1Q8R0H9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Gga1Q8R0H9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gga1Q8R0H9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gga1Q8R0H9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gga1Q8R0H9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gga1Q8R0H9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gga1Q8R0H9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gga1Q8R0H9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Gga1Q8R0H9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Gga1Q8R0H9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gga1Q8R0H9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gga1Q8R0H9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gga1Q8R0H9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gga1Q8R0H9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gga1Q8R0H9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gga1Q8R0H9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gga1Q8R0H9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Gga1Q8R0H9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gga1Q8R0H9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gga1Q8R0H9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gga1Q8R0H9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gga1Q8R0H9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gga1Q8R0H9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gga1Q8R0H9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gga1Q8R0H9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gga1Q8R0H9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gga1Q8R0H9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gga1Q8R0H9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gga1Q8R0H9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gga1Q8R0H9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gga1Q8R0H9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gga1Q8R0H9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gga1Q8R0H9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Gga1Q8R0H9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gga1Q8R0H9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gga1Q8R0H9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gga1Q8R0H9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gga1Q8R0H9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gga1Q8R0H9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gga1Q8R0H9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gga1Q8R0H9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms