Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxc12Q8K5B8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxc12Q8K5B8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxc12Q8K5B8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxc12Q8K5B8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxc12Q8K5B8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxc12Q8K5B8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxc12Q8K5B8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxc12Q8K5B8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxc12Q8K5B8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxc12Q8K5B8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxc12Q8K5B8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxc12Q8K5B8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Hoxc12Q8K5B8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxc12Q8K5B8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxc12Q8K5B8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxc12Q8K5B8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxc12Q8K5B8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxc12Q8K5B8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxc12Q8K5B8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxc12Q8K5B8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxc12Q8K5B8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxc12Q8K5B8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxc12Q8K5B8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxc12Q8K5B8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxc12Q8K5B8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxc12Q8K5B8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxc12Q8K5B8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxc12Q8K5B8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxc12Q8K5B8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxc12Q8K5B8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxc12Q8K5B8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxc12Q8K5B8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxc12Q8K5B8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxc12Q8K5B8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxc12Q8K5B8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxc12Q8K5B8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxc12Q8K5B8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxc12Q8K5B8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxc12Q8K5B8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxc12Q8K5B8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxc12Q8K5B8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxc12Q8K5B8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Hoxc12Q8K5B8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxc12Q8K5B8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxc12Q8K5B8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxc12Q8K5B8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxc12Q8K5B8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxc12Q8K5B8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxc12Q8K5B8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxc12Q8K5B8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxc12Q8K5B8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxc12Q8K5B8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxc12Q8K5B8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxc12Q8K5B8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxc12Q8K5B8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxc12Q8K5B8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxc12Q8K5B8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxc12Q8K5B8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxc12Q8K5B8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxc12Q8K5B8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxc12Q8K5B8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxc12Q8K5B8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxc12Q8K5B8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxc12Q8K5B8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxc12Q8K5B8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxc12Q8K5B8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxc12Q8K5B8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxc12Q8K5B8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxc12Q8K5B8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxc12Q8K5B8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxc12Q8K5B8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxc12Q8K5B8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxc12Q8K5B8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxc12Q8K5B8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxc12Q8K5B8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxc12Q8K5B8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxc12Q8K5B8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxc12Q8K5B8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxc12Q8K5B8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxc12Q8K5B8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxc12Q8K5B8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxc12Q8K5B8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxc12Q8K5B8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxc12Q8K5B8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxc12Q8K5B8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxc12Q8K5B8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxc12Q8K5B8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxc12Q8K5B8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Hoxc12Q8K5B8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxc12Q8K5B8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxc12Q8K5B8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxc12Q8K5B8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Hoxc12Q8K5B8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Hoxc12Q8K5B8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Hoxc12Q8K5B8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxc12Q8K5B8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxc12Q8K5B8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxc12Q8K5B8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Hoxc12Q8K5B8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 148.1 ms