Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3J1

Ndufs8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 8, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs8Q8K3J1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ndufs8Q8K3J1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ndufs8Q8K3J1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ndufs8Q8K3J1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ndufs8Q8K3J1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ndufs8Q8K3J1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ndufs8Q8K3J1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ndufs8Q8K3J1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ndufs8Q8K3J1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ndufs8Q8K3J1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ndufs8Q8K3J1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ndufs8Q8K3J1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ndufs8Q8K3J1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ndufs8Q8K3J1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ndufs8Q8K3J1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ndufs8Q8K3J1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ndufs8Q8K3J1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ndufs8Q8K3J1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ndufs8Q8K3J1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ndufs8Q8K3J1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ndufs8Q8K3J1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ndufs8Q8K3J1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ndufs8Q8K3J1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ndufs8Q8K3J1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ndufs8Q8K3J1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ndufs8Q8K3J1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ndufs8Q8K3J1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ndufs8Q8K3J1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ndufs8Q8K3J1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ndufs8Q8K3J1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ndufs8Q8K3J1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ndufs8Q8K3J1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ndufs8Q8K3J1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ndufs8Q8K3J1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ndufs8Q8K3J1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ndufs8Q8K3J1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ndufs8Q8K3J1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ndufs8Q8K3J1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ndufs8Q8K3J1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ndufs8Q8K3J1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ndufs8Q8K3J1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ndufs8Q8K3J1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ndufs8Q8K3J1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ndufs8Q8K3J1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ndufs8Q8K3J1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ndufs8Q8K3J1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ndufs8Q8K3J1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ndufs8Q8K3J1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ndufs8Q8K3J1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ndufs8Q8K3J1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ndufs8Q8K3J1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ndufs8Q8K3J1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ndufs8Q8K3J1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ndufs8Q8K3J1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ndufs8Q8K3J1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ndufs8Q8K3J1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ndufs8Q8K3J1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ndufs8Q8K3J1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ndufs8Q8K3J1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ndufs8Q8K3J1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ndufs8Q8K3J1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ndufs8Q8K3J1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ndufs8Q8K3J1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ndufs8Q8K3J1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ndufs8Q8K3J1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ndufs8Q8K3J1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ndufs8Q8K3J1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ndufs8Q8K3J1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ndufs8Q8K3J1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ndufs8Q8K3J1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ndufs8Q8K3J1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ndufs8Q8K3J1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ndufs8Q8K3J1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ndufs8Q8K3J1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ndufs8Q8K3J1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ndufs8Q8K3J1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ndufs8Q8K3J1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ndufs8Q8K3J1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ndufs8Q8K3J1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ndufs8Q8K3J1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ndufs8Q8K3J1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ndufs8Q8K3J1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ndufs8Q8K3J1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ndufs8Q8K3J1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ndufs8Q8K3J1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ndufs8Q8K3J1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ndufs8Q8K3J1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ndufs8Q8K3J1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ndufs8Q8K3J1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ndufs8Q8K3J1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ndufs8Q8K3J1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Ndufs8Q8K3J1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ndufs8Q8K3J1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ndufs8Q8K3J1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ndufs8Q8K3J1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ndufs8Q8K3J1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ndufs8Q8K3J1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ndufs8Q8K3J1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ndufs8Q8K3J1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ndufs8Q8K3J1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms