Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2M3

Srrd, SRR1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrdQ8K2M3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SrrdQ8K2M3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SrrdQ8K2M3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SrrdQ8K2M3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SrrdQ8K2M3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SrrdQ8K2M3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SrrdQ8K2M3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SrrdQ8K2M3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SrrdQ8K2M3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SrrdQ8K2M3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SrrdQ8K2M3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SrrdQ8K2M3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SrrdQ8K2M3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SrrdQ8K2M3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SrrdQ8K2M3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SrrdQ8K2M3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SrrdQ8K2M3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SrrdQ8K2M3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SrrdQ8K2M3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SrrdQ8K2M3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SrrdQ8K2M3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SrrdQ8K2M3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SrrdQ8K2M3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SrrdQ8K2M3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SrrdQ8K2M3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SrrdQ8K2M3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SrrdQ8K2M3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SrrdQ8K2M3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SrrdQ8K2M3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SrrdQ8K2M3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SrrdQ8K2M3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SrrdQ8K2M3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SrrdQ8K2M3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SrrdQ8K2M3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SrrdQ8K2M3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SrrdQ8K2M3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SrrdQ8K2M3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SrrdQ8K2M3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SrrdQ8K2M3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SrrdQ8K2M3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SrrdQ8K2M3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SrrdQ8K2M3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SrrdQ8K2M3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SrrdQ8K2M3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SrrdQ8K2M3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SrrdQ8K2M3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SrrdQ8K2M3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SrrdQ8K2M3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SrrdQ8K2M3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SrrdQ8K2M3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SrrdQ8K2M3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SrrdQ8K2M3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SrrdQ8K2M3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SrrdQ8K2M3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SrrdQ8K2M3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SrrdQ8K2M3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SrrdQ8K2M3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SrrdQ8K2M3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SrrdQ8K2M3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SrrdQ8K2M3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SrrdQ8K2M3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SrrdQ8K2M3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SrrdQ8K2M3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SrrdQ8K2M3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SrrdQ8K2M3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SrrdQ8K2M3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SrrdQ8K2M3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SrrdQ8K2M3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SrrdQ8K2M3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SrrdQ8K2M3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SrrdQ8K2M3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SrrdQ8K2M3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SrrdQ8K2M3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SrrdQ8K2M3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SrrdQ8K2M3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SrrdQ8K2M3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SrrdQ8K2M3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SrrdQ8K2M3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SrrdQ8K2M3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SrrdQ8K2M3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SrrdQ8K2M3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SrrdQ8K2M3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SrrdQ8K2M3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SrrdQ8K2M3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SrrdQ8K2M3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SrrdQ8K2M3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SrrdQ8K2M3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SrrdQ8K2M3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SrrdQ8K2M3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SrrdQ8K2M3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SrrdQ8K2M3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SrrdQ8K2M3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SrrdQ8K2M3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SrrdQ8K2M3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SrrdQ8K2M3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SrrdQ8K2M3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SrrdQ8K2M3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SrrdQ8K2M3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SrrdQ8K2M3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SrrdQ8K2M3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.8 ms