Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hpf1Q8CFE2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hpf1Q8CFE2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hpf1Q8CFE2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hpf1Q8CFE2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hpf1Q8CFE2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hpf1Q8CFE2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hpf1Q8CFE2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hpf1Q8CFE2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hpf1Q8CFE2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hpf1Q8CFE2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hpf1Q8CFE2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hpf1Q8CFE2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hpf1Q8CFE2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hpf1Q8CFE2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hpf1Q8CFE2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Hpf1Q8CFE2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hpf1Q8CFE2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hpf1Q8CFE2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hpf1Q8CFE2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hpf1Q8CFE2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hpf1Q8CFE2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hpf1Q8CFE2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hpf1Q8CFE2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hpf1Q8CFE2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hpf1Q8CFE2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hpf1Q8CFE2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hpf1Q8CFE2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hpf1Q8CFE2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hpf1Q8CFE2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hpf1Q8CFE2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hpf1Q8CFE2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hpf1Q8CFE2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hpf1Q8CFE2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hpf1Q8CFE2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hpf1Q8CFE2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hpf1Q8CFE2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hpf1Q8CFE2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hpf1Q8CFE2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hpf1Q8CFE2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hpf1Q8CFE2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hpf1Q8CFE2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hpf1Q8CFE2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Hpf1Q8CFE2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hpf1Q8CFE2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hpf1Q8CFE2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hpf1Q8CFE2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hpf1Q8CFE2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hpf1Q8CFE2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hpf1Q8CFE2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hpf1Q8CFE2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hpf1Q8CFE2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hpf1Q8CFE2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hpf1Q8CFE2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Hpf1Q8CFE2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hpf1Q8CFE2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hpf1Q8CFE2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hpf1Q8CFE2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hpf1Q8CFE2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hpf1Q8CFE2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hpf1Q8CFE2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hpf1Q8CFE2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Hpf1Q8CFE2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hpf1Q8CFE2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hpf1Q8CFE2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hpf1Q8CFE2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hpf1Q8CFE2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hpf1Q8CFE2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hpf1Q8CFE2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hpf1Q8CFE2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hpf1Q8CFE2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hpf1Q8CFE2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hpf1Q8CFE2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hpf1Q8CFE2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hpf1Q8CFE2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hpf1Q8CFE2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Hpf1Q8CFE2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Hpf1Q8CFE2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hpf1Q8CFE2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Hpf1Q8CFE2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Hpf1Q8CFE2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hpf1Q8CFE2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hpf1Q8CFE2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hpf1Q8CFE2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hpf1Q8CFE2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Hpf1Q8CFE2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hpf1Q8CFE2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hpf1Q8CFE2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hpf1Q8CFE2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Hpf1Q8CFE2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Hpf1Q8CFE2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Hpf1Q8CFE2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Hpf1Q8CFE2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Hpf1Q8CFE2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Hpf1Q8CFE2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hpf1Q8CFE2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Hpf1Q8CFE2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Hpf1Q8CFE2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hpf1Q8CFE2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hpf1Q8CFE2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
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