Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdkl1Q8CEQ0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdkl1Q8CEQ0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdkl1Q8CEQ0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdkl1Q8CEQ0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdkl1Q8CEQ0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdkl1Q8CEQ0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdkl1Q8CEQ0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdkl1Q8CEQ0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdkl1Q8CEQ0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdkl1Q8CEQ0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdkl1Q8CEQ0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdkl1Q8CEQ0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdkl1Q8CEQ0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdkl1Q8CEQ0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdkl1Q8CEQ0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cdkl1Q8CEQ0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdkl1Q8CEQ0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdkl1Q8CEQ0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdkl1Q8CEQ0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdkl1Q8CEQ0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdkl1Q8CEQ0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdkl1Q8CEQ0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdkl1Q8CEQ0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdkl1Q8CEQ0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdkl1Q8CEQ0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdkl1Q8CEQ0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdkl1Q8CEQ0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdkl1Q8CEQ0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdkl1Q8CEQ0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdkl1Q8CEQ0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdkl1Q8CEQ0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdkl1Q8CEQ0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdkl1Q8CEQ0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdkl1Q8CEQ0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdkl1Q8CEQ0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdkl1Q8CEQ0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdkl1Q8CEQ0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdkl1Q8CEQ0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdkl1Q8CEQ0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdkl1Q8CEQ0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdkl1Q8CEQ0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdkl1Q8CEQ0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdkl1Q8CEQ0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdkl1Q8CEQ0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdkl1Q8CEQ0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdkl1Q8CEQ0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdkl1Q8CEQ0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdkl1Q8CEQ0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdkl1Q8CEQ0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdkl1Q8CEQ0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdkl1Q8CEQ0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdkl1Q8CEQ0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdkl1Q8CEQ0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdkl1Q8CEQ0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdkl1Q8CEQ0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdkl1Q8CEQ0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdkl1Q8CEQ0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdkl1Q8CEQ0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdkl1Q8CEQ0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdkl1Q8CEQ0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdkl1Q8CEQ0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdkl1Q8CEQ0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdkl1Q8CEQ0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdkl1Q8CEQ0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdkl1Q8CEQ0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdkl1Q8CEQ0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cdkl1Q8CEQ0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdkl1Q8CEQ0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdkl1Q8CEQ0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdkl1Q8CEQ0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdkl1Q8CEQ0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdkl1Q8CEQ0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdkl1Q8CEQ0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdkl1Q8CEQ0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdkl1Q8CEQ0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdkl1Q8CEQ0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdkl1Q8CEQ0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdkl1Q8CEQ0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdkl1Q8CEQ0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdkl1Q8CEQ0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdkl1Q8CEQ0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdkl1Q8CEQ0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdkl1Q8CEQ0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdkl1Q8CEQ0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdkl1Q8CEQ0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdkl1Q8CEQ0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdkl1Q8CEQ0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cdkl1Q8CEQ0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdkl1Q8CEQ0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdkl1Q8CEQ0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cdkl1Q8CEQ0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cdkl1Q8CEQ0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms