Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEJ8

Gm9955, Predicted gene 9955 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9955Q8CEJ8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm9955Q8CEJ8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm9955Q8CEJ8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm9955Q8CEJ8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm9955Q8CEJ8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm9955Q8CEJ8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm9955Q8CEJ8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm9955Q8CEJ8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm9955Q8CEJ8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm9955Q8CEJ8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm9955Q8CEJ8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm9955Q8CEJ8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm9955Q8CEJ8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm9955Q8CEJ8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm9955Q8CEJ8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm9955Q8CEJ8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm9955Q8CEJ8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm9955Q8CEJ8 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm9955Q8CEJ8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm9955Q8CEJ8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm9955Q8CEJ8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm9955Q8CEJ8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm9955Q8CEJ8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm9955Q8CEJ8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm9955Q8CEJ8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm9955Q8CEJ8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm9955Q8CEJ8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm9955Q8CEJ8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm9955Q8CEJ8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm9955Q8CEJ8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm9955Q8CEJ8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm9955Q8CEJ8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm9955Q8CEJ8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm9955Q8CEJ8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm9955Q8CEJ8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm9955Q8CEJ8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Gm9955Q8CEJ8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm9955Q8CEJ8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm9955Q8CEJ8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm9955Q8CEJ8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm9955Q8CEJ8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm9955Q8CEJ8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm9955Q8CEJ8 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm9955Q8CEJ8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Gm9955Q8CEJ8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm9955Q8CEJ8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm9955Q8CEJ8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm9955Q8CEJ8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm9955Q8CEJ8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm9955Q8CEJ8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm9955Q8CEJ8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm9955Q8CEJ8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm9955Q8CEJ8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Gm9955Q8CEJ8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm9955Q8CEJ8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Gm9955Q8CEJ8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm9955Q8CEJ8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm9955Q8CEJ8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm9955Q8CEJ8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm9955Q8CEJ8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm9955Q8CEJ8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm9955Q8CEJ8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Gm9955Q8CEJ8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Gm9955Q8CEJ8 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm9955Q8CEJ8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm9955Q8CEJ8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm9955Q8CEJ8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm9955Q8CEJ8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm9955Q8CEJ8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm9955Q8CEJ8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm9955Q8CEJ8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Gm9955Q8CEJ8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm9955Q8CEJ8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm9955Q8CEJ8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm9955Q8CEJ8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm9955Q8CEJ8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Gm9955Q8CEJ8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm9955Q8CEJ8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm9955Q8CEJ8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm9955Q8CEJ8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm9955Q8CEJ8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm9955Q8CEJ8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm9955Q8CEJ8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm9955Q8CEJ8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm9955Q8CEJ8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Gm9955Q8CEJ8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm9955Q8CEJ8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm9955Q8CEJ8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm9955Q8CEJ8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm9955Q8CEJ8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm9955Q8CEJ8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm9955Q8CEJ8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm9955Q8CEJ8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Gm9955Q8CEJ8 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm9955Q8CEJ8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm9955Q8CEJ8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm9955Q8CEJ8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm9955Q8CEJ8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Gm9955Q8CEJ8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gm9955Q8CEJ8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms