Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV0

Ccdc178, Coiled-coil domain-containing protein 178, mousemouse

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc178Q8CDV0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Ccdc178Q8CDV0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc178Q8CDV0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc178Q8CDV0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc178Q8CDV0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc178Q8CDV0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc178Q8CDV0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc178Q8CDV0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc178Q8CDV0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc178Q8CDV0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc178Q8CDV0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc178Q8CDV0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc178Q8CDV0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc178Q8CDV0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc178Q8CDV0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc178Q8CDV0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc178Q8CDV0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccdc178Q8CDV0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc178Q8CDV0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc178Q8CDV0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc178Q8CDV0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc178Q8CDV0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc178Q8CDV0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc178Q8CDV0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc178Q8CDV0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc178Q8CDV0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc178Q8CDV0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc178Q8CDV0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc178Q8CDV0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc178Q8CDV0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc178Q8CDV0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc178Q8CDV0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ccdc178Q8CDV0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc178Q8CDV0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc178Q8CDV0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc178Q8CDV0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc178Q8CDV0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc178Q8CDV0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc178Q8CDV0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc178Q8CDV0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc178Q8CDV0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc178Q8CDV0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc178Q8CDV0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc178Q8CDV0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc178Q8CDV0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc178Q8CDV0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc178Q8CDV0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc178Q8CDV0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc178Q8CDV0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc178Q8CDV0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc178Q8CDV0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc178Q8CDV0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc178Q8CDV0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc178Q8CDV0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc178Q8CDV0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc178Q8CDV0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc178Q8CDV0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc178Q8CDV0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc178Q8CDV0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc178Q8CDV0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc178Q8CDV0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc178Q8CDV0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ccdc178Q8CDV0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc178Q8CDV0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc178Q8CDV0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc178Q8CDV0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc178Q8CDV0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc178Q8CDV0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc178Q8CDV0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc178Q8CDV0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc178Q8CDV0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc178Q8CDV0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc178Q8CDV0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc178Q8CDV0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc178Q8CDV0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc178Q8CDV0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc178Q8CDV0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc178Q8CDV0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc178Q8CDV0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc178Q8CDV0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ccdc178Q8CDV0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc178Q8CDV0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc178Q8CDV0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc178Q8CDV0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc178Q8CDV0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc178Q8CDV0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc178Q8CDV0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc178Q8CDV0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc178Q8CDV0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc178Q8CDV0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc178Q8CDV0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc178Q8CDV0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc178Q8CDV0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc178Q8CDV0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc178Q8CDV0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc178Q8CDV0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc178Q8CDV0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc178Q8CDV0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc178Q8CDV0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ccdc178Q8CDV0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms