Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCN5

Bcas3, Breast carcinoma-amplified sequence 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcas3Q8CCN5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Bcas3Q8CCN5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Bcas3Q8CCN5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Bcas3Q8CCN5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Bcas3Q8CCN5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Bcas3Q8CCN5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Bcas3Q8CCN5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Bcas3Q8CCN5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Bcas3Q8CCN5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Bcas3Q8CCN5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Bcas3Q8CCN5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Bcas3Q8CCN5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Bcas3Q8CCN5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Bcas3Q8CCN5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Bcas3Q8CCN5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Bcas3Q8CCN5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Bcas3Q8CCN5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Bcas3Q8CCN5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Bcas3Q8CCN5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Bcas3Q8CCN5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Bcas3Q8CCN5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Bcas3Q8CCN5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Bcas3Q8CCN5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Bcas3Q8CCN5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Bcas3Q8CCN5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Bcas3Q8CCN5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Bcas3Q8CCN5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Bcas3Q8CCN5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Bcas3Q8CCN5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Bcas3Q8CCN5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Bcas3Q8CCN5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Bcas3Q8CCN5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Bcas3Q8CCN5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Bcas3Q8CCN5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Bcas3Q8CCN5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Bcas3Q8CCN5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Bcas3Q8CCN5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Bcas3Q8CCN5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Bcas3Q8CCN5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Bcas3Q8CCN5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Bcas3Q8CCN5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Bcas3Q8CCN5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Bcas3Q8CCN5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Bcas3Q8CCN5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Bcas3Q8CCN5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Bcas3Q8CCN5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Bcas3Q8CCN5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Bcas3Q8CCN5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Bcas3Q8CCN5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Bcas3Q8CCN5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Bcas3Q8CCN5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Bcas3Q8CCN5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Bcas3Q8CCN5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Bcas3Q8CCN5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Bcas3Q8CCN5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Bcas3Q8CCN5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Bcas3Q8CCN5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Bcas3Q8CCN5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Bcas3Q8CCN5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Bcas3Q8CCN5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Bcas3Q8CCN5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Bcas3Q8CCN5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Bcas3Q8CCN5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Bcas3Q8CCN5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Bcas3Q8CCN5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Bcas3Q8CCN5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Bcas3Q8CCN5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Bcas3Q8CCN5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Bcas3Q8CCN5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Bcas3Q8CCN5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Bcas3Q8CCN5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Bcas3Q8CCN5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Bcas3Q8CCN5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Bcas3Q8CCN5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Bcas3Q8CCN5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Bcas3Q8CCN5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Bcas3Q8CCN5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Bcas3Q8CCN5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Bcas3Q8CCN5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Bcas3Q8CCN5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Bcas3Q8CCN5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Bcas3Q8CCN5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Bcas3Q8CCN5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Bcas3Q8CCN5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Bcas3Q8CCN5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Bcas3Q8CCN5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Bcas3Q8CCN5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Bcas3Q8CCN5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Bcas3Q8CCN5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Bcas3Q8CCN5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Bcas3Q8CCN5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Bcas3Q8CCN5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Bcas3Q8CCN5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Bcas3Q8CCN5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Bcas3Q8CCN5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Bcas3Q8CCN5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Bcas3Q8CCN5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Bcas3Q8CCN5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Bcas3Q8CCN5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Bcas3Q8CCN5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms