Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB49

Tprg1, Tumor protein p63-regulated gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tprg1Q8CB49 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tprg1Q8CB49 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tprg1Q8CB49 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tprg1Q8CB49 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tprg1Q8CB49 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tprg1Q8CB49 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tprg1Q8CB49 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tprg1Q8CB49 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tprg1Q8CB49 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tprg1Q8CB49 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tprg1Q8CB49 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tprg1Q8CB49 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tprg1Q8CB49 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tprg1Q8CB49 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tprg1Q8CB49 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tprg1Q8CB49 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Tprg1Q8CB49 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Tprg1Q8CB49 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tprg1Q8CB49 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tprg1Q8CB49 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tprg1Q8CB49 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tprg1Q8CB49 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tprg1Q8CB49 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tprg1Q8CB49 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tprg1Q8CB49 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tprg1Q8CB49 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tprg1Q8CB49 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tprg1Q8CB49 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tprg1Q8CB49 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tprg1Q8CB49 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tprg1Q8CB49 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tprg1Q8CB49 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tprg1Q8CB49 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tprg1Q8CB49 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tprg1Q8CB49 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tprg1Q8CB49 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Tprg1Q8CB49 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tprg1Q8CB49 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tprg1Q8CB49 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tprg1Q8CB49 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Tprg1Q8CB49 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tprg1Q8CB49 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tprg1Q8CB49 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tprg1Q8CB49 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tprg1Q8CB49 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tprg1Q8CB49 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tprg1Q8CB49 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tprg1Q8CB49 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tprg1Q8CB49 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tprg1Q8CB49 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tprg1Q8CB49 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tprg1Q8CB49 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tprg1Q8CB49 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tprg1Q8CB49 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tprg1Q8CB49 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tprg1Q8CB49 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tprg1Q8CB49 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tprg1Q8CB49 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tprg1Q8CB49 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tprg1Q8CB49 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tprg1Q8CB49 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tprg1Q8CB49 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tprg1Q8CB49 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tprg1Q8CB49 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tprg1Q8CB49 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tprg1Q8CB49 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tprg1Q8CB49 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tprg1Q8CB49 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tprg1Q8CB49 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tprg1Q8CB49 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Tprg1Q8CB49 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tprg1Q8CB49 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tprg1Q8CB49 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tprg1Q8CB49 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tprg1Q8CB49 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tprg1Q8CB49 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tprg1Q8CB49 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tprg1Q8CB49 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tprg1Q8CB49 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tprg1Q8CB49 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tprg1Q8CB49 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tprg1Q8CB49 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tprg1Q8CB49 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tprg1Q8CB49 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tprg1Q8CB49 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tprg1Q8CB49 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tprg1Q8CB49 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tprg1Q8CB49 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tprg1Q8CB49 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tprg1Q8CB49 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tprg1Q8CB49 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tprg1Q8CB49 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tprg1Q8CB49 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tprg1Q8CB49 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tprg1Q8CB49 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tprg1Q8CB49 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tprg1Q8CB49 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tprg1Q8CB49 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tprg1Q8CB49 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tprg1Q8CB49 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms