Protein–RNA interactions for Protein: Q8C120

Sh3rf3, SH3 domain-containing RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3rf3Q8C120 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sh3rf3Q8C120 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sh3rf3Q8C120 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sh3rf3Q8C120 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sh3rf3Q8C120 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sh3rf3Q8C120 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sh3rf3Q8C120 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sh3rf3Q8C120 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sh3rf3Q8C120 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sh3rf3Q8C120 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sh3rf3Q8C120 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sh3rf3Q8C120 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sh3rf3Q8C120 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sh3rf3Q8C120 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sh3rf3Q8C120 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sh3rf3Q8C120 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sh3rf3Q8C120 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sh3rf3Q8C120 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sh3rf3Q8C120 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sh3rf3Q8C120 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sh3rf3Q8C120 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sh3rf3Q8C120 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sh3rf3Q8C120 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sh3rf3Q8C120 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sh3rf3Q8C120 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sh3rf3Q8C120 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sh3rf3Q8C120 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sh3rf3Q8C120 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sh3rf3Q8C120 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sh3rf3Q8C120 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sh3rf3Q8C120 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Sh3rf3Q8C120 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sh3rf3Q8C120 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sh3rf3Q8C120 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sh3rf3Q8C120 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sh3rf3Q8C120 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sh3rf3Q8C120 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sh3rf3Q8C120 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sh3rf3Q8C120 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sh3rf3Q8C120 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sh3rf3Q8C120 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sh3rf3Q8C120 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sh3rf3Q8C120 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sh3rf3Q8C120 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sh3rf3Q8C120 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sh3rf3Q8C120 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Sh3rf3Q8C120 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sh3rf3Q8C120 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sh3rf3Q8C120 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sh3rf3Q8C120 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sh3rf3Q8C120 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sh3rf3Q8C120 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sh3rf3Q8C120 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sh3rf3Q8C120 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sh3rf3Q8C120 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Sh3rf3Q8C120 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sh3rf3Q8C120 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Sh3rf3Q8C120 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sh3rf3Q8C120 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sh3rf3Q8C120 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sh3rf3Q8C120 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sh3rf3Q8C120 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sh3rf3Q8C120 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sh3rf3Q8C120 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sh3rf3Q8C120 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Sh3rf3Q8C120 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sh3rf3Q8C120 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sh3rf3Q8C120 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sh3rf3Q8C120 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sh3rf3Q8C120 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sh3rf3Q8C120 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sh3rf3Q8C120 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sh3rf3Q8C120 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sh3rf3Q8C120 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sh3rf3Q8C120 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sh3rf3Q8C120 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Sh3rf3Q8C120 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sh3rf3Q8C120 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Sh3rf3Q8C120 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sh3rf3Q8C120 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sh3rf3Q8C120 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sh3rf3Q8C120 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sh3rf3Q8C120 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sh3rf3Q8C120 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sh3rf3Q8C120 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sh3rf3Q8C120 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sh3rf3Q8C120 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sh3rf3Q8C120 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sh3rf3Q8C120 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sh3rf3Q8C120 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sh3rf3Q8C120 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sh3rf3Q8C120 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Sh3rf3Q8C120 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sh3rf3Q8C120 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sh3rf3Q8C120 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sh3rf3Q8C120 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sh3rf3Q8C120 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sh3rf3Q8C120 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sh3rf3Q8C120 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sh3rf3Q8C120 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms