Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL7

Arfrp1, ADP-ribosylation factor-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfrp1Q8BXL7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arfrp1Q8BXL7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arfrp1Q8BXL7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arfrp1Q8BXL7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arfrp1Q8BXL7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arfrp1Q8BXL7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arfrp1Q8BXL7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arfrp1Q8BXL7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arfrp1Q8BXL7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Arfrp1Q8BXL7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arfrp1Q8BXL7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arfrp1Q8BXL7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arfrp1Q8BXL7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arfrp1Q8BXL7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arfrp1Q8BXL7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arfrp1Q8BXL7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arfrp1Q8BXL7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arfrp1Q8BXL7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arfrp1Q8BXL7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arfrp1Q8BXL7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arfrp1Q8BXL7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Arfrp1Q8BXL7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arfrp1Q8BXL7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arfrp1Q8BXL7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Arfrp1Q8BXL7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Arfrp1Q8BXL7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Arfrp1Q8BXL7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Arfrp1Q8BXL7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Arfrp1Q8BXL7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Arfrp1Q8BXL7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Arfrp1Q8BXL7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Arfrp1Q8BXL7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arfrp1Q8BXL7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arfrp1Q8BXL7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arfrp1Q8BXL7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arfrp1Q8BXL7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Arfrp1Q8BXL7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arfrp1Q8BXL7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arfrp1Q8BXL7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Arfrp1Q8BXL7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arfrp1Q8BXL7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arfrp1Q8BXL7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arfrp1Q8BXL7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arfrp1Q8BXL7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arfrp1Q8BXL7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arfrp1Q8BXL7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arfrp1Q8BXL7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arfrp1Q8BXL7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arfrp1Q8BXL7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Arfrp1Q8BXL7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Arfrp1Q8BXL7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Arfrp1Q8BXL7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Arfrp1Q8BXL7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Arfrp1Q8BXL7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Arfrp1Q8BXL7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Arfrp1Q8BXL7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Arfrp1Q8BXL7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Arfrp1Q8BXL7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Arfrp1Q8BXL7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Arfrp1Q8BXL7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Arfrp1Q8BXL7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Arfrp1Q8BXL7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Arfrp1Q8BXL7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Arfrp1Q8BXL7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Arfrp1Q8BXL7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Arfrp1Q8BXL7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Arfrp1Q8BXL7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Arfrp1Q8BXL7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Arfrp1Q8BXL7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Arfrp1Q8BXL7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Arfrp1Q8BXL7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Arfrp1Q8BXL7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Arfrp1Q8BXL7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Arfrp1Q8BXL7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Arfrp1Q8BXL7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Arfrp1Q8BXL7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Arfrp1Q8BXL7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Arfrp1Q8BXL7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Arfrp1Q8BXL7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Arfrp1Q8BXL7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Arfrp1Q8BXL7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Arfrp1Q8BXL7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Arfrp1Q8BXL7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Arfrp1Q8BXL7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Arfrp1Q8BXL7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Arfrp1Q8BXL7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Arfrp1Q8BXL7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Arfrp1Q8BXL7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Arfrp1Q8BXL7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Arfrp1Q8BXL7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Arfrp1Q8BXL7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Arfrp1Q8BXL7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Arfrp1Q8BXL7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Arfrp1Q8BXL7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Arfrp1Q8BXL7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Arfrp1Q8BXL7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Arfrp1Q8BXL7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Arfrp1Q8BXL7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Arfrp1Q8BXL7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Arfrp1Q8BXL7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.5 ms