Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV84

Prr9, Proline-rich protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr9Q8BV84 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,24■□□□□ 0,51
Prr9Q8BV84 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,24■□□□□ 0,51
Prr9Q8BV84 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,23■□□□□ 0,51
Prr9Q8BV84 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,23■□□□□ 0,51
Prr9Q8BV84 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,22■□□□□ 0,51
Prr9Q8BV84 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,22■□□□□ 0,51
Prr9Q8BV84 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18,22■□□□□ 0,51
Prr9Q8BV84 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,22■□□□□ 0,51
Prr9Q8BV84 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,22■□□□□ 0,51
Prr9Q8BV84 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18,22■□□□□ 0,51
Prr9Q8BV84 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,21■□□□□ 0,51
Prr9Q8BV84 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,21■□□□□ 0,51
Prr9Q8BV84 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18,21■□□□□ 0,51
Prr9Q8BV84 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,2■□□□□ 0,5
Prr9Q8BV84 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,2■□□□□ 0,5
Prr9Q8BV84 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,2■□□□□ 0,5
Prr9Q8BV84 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,2■□□□□ 0,5
Prr9Q8BV84 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18,2■□□□□ 0,5
Prr9Q8BV84 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,2■□□□□ 0,5
Prr9Q8BV84 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18,2■□□□□ 0,5
Prr9Q8BV84 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,19■□□□□ 0,5
Prr9Q8BV84 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18,19■□□□□ 0,5
Prr9Q8BV84 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,19■□□□□ 0,5
Prr9Q8BV84 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,19■□□□□ 0,5
Prr9Q8BV84 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC18,18■□□□□ 0,5
Prr9Q8BV84 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18,17■□□□□ 0,5
Prr9Q8BV84 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,17■□□□□ 0,5
Prr9Q8BV84 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18,17■□□□□ 0,5
Prr9Q8BV84 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18,17■□□□□ 0,5
Prr9Q8BV84 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,16■□□□□ 0,5
Prr9Q8BV84 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18,16■□□□□ 0,5
Prr9Q8BV84 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18,16■□□□□ 0,5
Prr9Q8BV84 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18,16■□□□□ 0,5
Prr9Q8BV84 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18,16■□□□□ 0,5
Prr9Q8BV84 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18,16■□□□□ 0,5
Prr9Q8BV84 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18,15■□□□□ 0,5
Prr9Q8BV84 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,15■□□□□ 0,5
Prr9Q8BV84 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,15■□□□□ 0,5
Prr9Q8BV84 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18,15■□□□□ 0,5
Prr9Q8BV84 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18,14■□□□□ 0,49
Prr9Q8BV84 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18,14■□□□□ 0,49
Prr9Q8BV84 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18,14■□□□□ 0,49
Prr9Q8BV84 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18,14■□□□□ 0,49
Prr9Q8BV84 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18,14■□□□□ 0,49
Prr9Q8BV84 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18,13■□□□□ 0,49
Prr9Q8BV84 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18,13■□□□□ 0,49
Prr9Q8BV84 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18,13■□□□□ 0,49
Prr9Q8BV84 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,13■□□□□ 0,49
Prr9Q8BV84 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,13■□□□□ 0,49
Prr9Q8BV84 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,12■□□□□ 0,49
Prr9Q8BV84 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,12■□□□□ 0,49
Prr9Q8BV84 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,12■□□□□ 0,49
Prr9Q8BV84 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,11■□□□□ 0,49
Prr9Q8BV84 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18,11■□□□□ 0,49
Prr9Q8BV84 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,11■□□□□ 0,49
Prr9Q8BV84 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,11■□□□□ 0,49
Prr9Q8BV84 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18,1■□□□□ 0,49
Prr9Q8BV84 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,1■□□□□ 0,49
Prr9Q8BV84 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,1■□□□□ 0,49
Prr9Q8BV84 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,1■□□□□ 0,49
Prr9Q8BV84 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18,1■□□□□ 0,49
Prr9Q8BV84 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,09■□□□□ 0,49
Prr9Q8BV84 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18,09■□□□□ 0,49
Prr9Q8BV84 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,09■□□□□ 0,49
Prr9Q8BV84 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,09■□□□□ 0,49
Prr9Q8BV84 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18,09■□□□□ 0,49
Prr9Q8BV84 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,09■□□□□ 0,49
Prr9Q8BV84 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,08■□□□□ 0,49
Prr9Q8BV84 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18,08■□□□□ 0,49
Prr9Q8BV84 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,08■□□□□ 0,49
Prr9Q8BV84 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,08■□□□□ 0,49
Prr9Q8BV84 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18,08■□□□□ 0,48
Prr9Q8BV84 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18,08■□□□□ 0,48
Prr9Q8BV84 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,08■□□□□ 0,48
Prr9Q8BV84 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,08■□□□□ 0,48
Prr9Q8BV84 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,07■□□□□ 0,48
Prr9Q8BV84 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18,07■□□□□ 0,48
Prr9Q8BV84 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18,07■□□□□ 0,48
Prr9Q8BV84 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,07■□□□□ 0,48
Prr9Q8BV84 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,07■□□□□ 0,48
Prr9Q8BV84 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18,06■□□□□ 0,48
Prr9Q8BV84 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18,06■□□□□ 0,48
Prr9Q8BV84 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18,06■□□□□ 0,48
Prr9Q8BV84 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,05■□□□□ 0,48
Prr9Q8BV84 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18,05■□□□□ 0,48
Prr9Q8BV84 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18,05■□□□□ 0,48
Prr9Q8BV84 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18,05■□□□□ 0,48
Prr9Q8BV84 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18,04■□□□□ 0,48
Prr9Q8BV84 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18,04■□□□□ 0,48
Prr9Q8BV84 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18,04■□□□□ 0,48
Prr9Q8BV84 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,03■□□□□ 0,48
Prr9Q8BV84 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18,03■□□□□ 0,48
Prr9Q8BV84 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18,03■□□□□ 0,48
Prr9Q8BV84 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18,02■□□□□ 0,48
Prr9Q8BV84 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18,02■□□□□ 0,47
Prr9Q8BV84 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18,02■□□□□ 0,47
Prr9Q8BV84 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18,02■□□□□ 0,47
Prr9Q8BV84 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18,01■□□□□ 0,47
Prr9Q8BV84 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,01■□□□□ 0,47
Prr9Q8BV84 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18,01■□□□□ 0,47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30,7 ms