Protein–RNA interactions for Protein: Q8BU47

E330017A01Rik, Ferritin, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330017A01RikQ8BU47 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
E330017A01RikQ8BU47 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
E330017A01RikQ8BU47 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
E330017A01RikQ8BU47 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
E330017A01RikQ8BU47 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
E330017A01RikQ8BU47 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
E330017A01RikQ8BU47 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
E330017A01RikQ8BU47 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
E330017A01RikQ8BU47 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
E330017A01RikQ8BU47 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
E330017A01RikQ8BU47 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
E330017A01RikQ8BU47 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
E330017A01RikQ8BU47 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
E330017A01RikQ8BU47 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
E330017A01RikQ8BU47 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
E330017A01RikQ8BU47 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
E330017A01RikQ8BU47 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
E330017A01RikQ8BU47 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
E330017A01RikQ8BU47 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
E330017A01RikQ8BU47 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
E330017A01RikQ8BU47 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
E330017A01RikQ8BU47 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
E330017A01RikQ8BU47 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
E330017A01RikQ8BU47 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
E330017A01RikQ8BU47 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
E330017A01RikQ8BU47 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
E330017A01RikQ8BU47 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
E330017A01RikQ8BU47 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
E330017A01RikQ8BU47 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
E330017A01RikQ8BU47 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
E330017A01RikQ8BU47 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
E330017A01RikQ8BU47 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
E330017A01RikQ8BU47 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
E330017A01RikQ8BU47 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
E330017A01RikQ8BU47 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
E330017A01RikQ8BU47 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
E330017A01RikQ8BU47 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
E330017A01RikQ8BU47 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
E330017A01RikQ8BU47 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
E330017A01RikQ8BU47 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
E330017A01RikQ8BU47 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
E330017A01RikQ8BU47 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
E330017A01RikQ8BU47 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
E330017A01RikQ8BU47 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
E330017A01RikQ8BU47 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
E330017A01RikQ8BU47 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
E330017A01RikQ8BU47 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
E330017A01RikQ8BU47 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
E330017A01RikQ8BU47 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
E330017A01RikQ8BU47 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
E330017A01RikQ8BU47 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
E330017A01RikQ8BU47 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
E330017A01RikQ8BU47 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
E330017A01RikQ8BU47 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
E330017A01RikQ8BU47 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
E330017A01RikQ8BU47 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
E330017A01RikQ8BU47 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
E330017A01RikQ8BU47 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
E330017A01RikQ8BU47 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
E330017A01RikQ8BU47 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
E330017A01RikQ8BU47 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
E330017A01RikQ8BU47 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
E330017A01RikQ8BU47 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
E330017A01RikQ8BU47 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
E330017A01RikQ8BU47 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
E330017A01RikQ8BU47 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
E330017A01RikQ8BU47 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
E330017A01RikQ8BU47 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
E330017A01RikQ8BU47 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
E330017A01RikQ8BU47 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
E330017A01RikQ8BU47 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
E330017A01RikQ8BU47 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
E330017A01RikQ8BU47 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
E330017A01RikQ8BU47 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
E330017A01RikQ8BU47 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
E330017A01RikQ8BU47 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
E330017A01RikQ8BU47 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
E330017A01RikQ8BU47 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
E330017A01RikQ8BU47 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
E330017A01RikQ8BU47 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
E330017A01RikQ8BU47 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
E330017A01RikQ8BU47 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
E330017A01RikQ8BU47 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
E330017A01RikQ8BU47 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
E330017A01RikQ8BU47 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
E330017A01RikQ8BU47 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
E330017A01RikQ8BU47 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
E330017A01RikQ8BU47 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
E330017A01RikQ8BU47 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
E330017A01RikQ8BU47 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
E330017A01RikQ8BU47 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
E330017A01RikQ8BU47 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
E330017A01RikQ8BU47 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
E330017A01RikQ8BU47 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
E330017A01RikQ8BU47 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
E330017A01RikQ8BU47 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
E330017A01RikQ8BU47 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
E330017A01RikQ8BU47 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
E330017A01RikQ8BU47 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
E330017A01RikQ8BU47 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms