Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTU7

Rccd1, RCC1 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rccd1Q8BTU7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Rccd1Q8BTU7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rccd1Q8BTU7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rccd1Q8BTU7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rccd1Q8BTU7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rccd1Q8BTU7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rccd1Q8BTU7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rccd1Q8BTU7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rccd1Q8BTU7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rccd1Q8BTU7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rccd1Q8BTU7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rccd1Q8BTU7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rccd1Q8BTU7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Rccd1Q8BTU7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rccd1Q8BTU7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rccd1Q8BTU7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rccd1Q8BTU7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rccd1Q8BTU7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rccd1Q8BTU7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rccd1Q8BTU7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rccd1Q8BTU7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rccd1Q8BTU7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rccd1Q8BTU7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rccd1Q8BTU7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rccd1Q8BTU7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rccd1Q8BTU7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rccd1Q8BTU7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rccd1Q8BTU7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rccd1Q8BTU7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rccd1Q8BTU7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rccd1Q8BTU7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rccd1Q8BTU7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rccd1Q8BTU7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rccd1Q8BTU7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rccd1Q8BTU7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rccd1Q8BTU7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rccd1Q8BTU7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rccd1Q8BTU7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rccd1Q8BTU7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rccd1Q8BTU7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rccd1Q8BTU7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rccd1Q8BTU7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rccd1Q8BTU7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rccd1Q8BTU7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rccd1Q8BTU7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rccd1Q8BTU7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rccd1Q8BTU7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rccd1Q8BTU7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rccd1Q8BTU7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rccd1Q8BTU7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rccd1Q8BTU7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rccd1Q8BTU7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rccd1Q8BTU7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rccd1Q8BTU7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rccd1Q8BTU7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Rccd1Q8BTU7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Rccd1Q8BTU7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rccd1Q8BTU7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rccd1Q8BTU7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rccd1Q8BTU7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rccd1Q8BTU7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rccd1Q8BTU7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rccd1Q8BTU7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rccd1Q8BTU7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rccd1Q8BTU7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rccd1Q8BTU7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rccd1Q8BTU7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rccd1Q8BTU7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rccd1Q8BTU7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rccd1Q8BTU7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rccd1Q8BTU7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rccd1Q8BTU7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rccd1Q8BTU7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rccd1Q8BTU7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rccd1Q8BTU7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rccd1Q8BTU7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rccd1Q8BTU7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rccd1Q8BTU7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rccd1Q8BTU7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rccd1Q8BTU7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rccd1Q8BTU7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rccd1Q8BTU7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rccd1Q8BTU7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rccd1Q8BTU7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rccd1Q8BTU7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rccd1Q8BTU7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rccd1Q8BTU7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rccd1Q8BTU7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rccd1Q8BTU7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rccd1Q8BTU7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rccd1Q8BTU7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rccd1Q8BTU7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rccd1Q8BTU7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Rccd1Q8BTU7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rccd1Q8BTU7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rccd1Q8BTU7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rccd1Q8BTU7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rccd1Q8BTU7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rccd1Q8BTU7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rccd1Q8BTU7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms