Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTU1

Cfap20, Cilia- and flagella-associated protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap20Q8BTU1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cfap20Q8BTU1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cfap20Q8BTU1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cfap20Q8BTU1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cfap20Q8BTU1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Cfap20Q8BTU1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Cfap20Q8BTU1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Cfap20Q8BTU1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cfap20Q8BTU1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cfap20Q8BTU1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cfap20Q8BTU1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cfap20Q8BTU1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cfap20Q8BTU1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cfap20Q8BTU1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cfap20Q8BTU1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cfap20Q8BTU1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cfap20Q8BTU1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cfap20Q8BTU1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cfap20Q8BTU1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cfap20Q8BTU1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cfap20Q8BTU1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cfap20Q8BTU1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cfap20Q8BTU1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cfap20Q8BTU1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cfap20Q8BTU1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cfap20Q8BTU1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cfap20Q8BTU1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cfap20Q8BTU1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cfap20Q8BTU1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Cfap20Q8BTU1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cfap20Q8BTU1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cfap20Q8BTU1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cfap20Q8BTU1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cfap20Q8BTU1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cfap20Q8BTU1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cfap20Q8BTU1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cfap20Q8BTU1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cfap20Q8BTU1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Cfap20Q8BTU1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cfap20Q8BTU1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cfap20Q8BTU1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cfap20Q8BTU1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cfap20Q8BTU1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cfap20Q8BTU1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cfap20Q8BTU1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cfap20Q8BTU1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cfap20Q8BTU1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cfap20Q8BTU1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Cfap20Q8BTU1 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Cfap20Q8BTU1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cfap20Q8BTU1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cfap20Q8BTU1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Cfap20Q8BTU1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cfap20Q8BTU1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cfap20Q8BTU1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cfap20Q8BTU1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cfap20Q8BTU1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cfap20Q8BTU1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cfap20Q8BTU1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cfap20Q8BTU1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cfap20Q8BTU1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cfap20Q8BTU1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cfap20Q8BTU1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cfap20Q8BTU1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cfap20Q8BTU1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cfap20Q8BTU1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Cfap20Q8BTU1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cfap20Q8BTU1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cfap20Q8BTU1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cfap20Q8BTU1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cfap20Q8BTU1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cfap20Q8BTU1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cfap20Q8BTU1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cfap20Q8BTU1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cfap20Q8BTU1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cfap20Q8BTU1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Cfap20Q8BTU1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cfap20Q8BTU1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cfap20Q8BTU1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cfap20Q8BTU1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cfap20Q8BTU1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cfap20Q8BTU1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cfap20Q8BTU1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cfap20Q8BTU1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cfap20Q8BTU1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cfap20Q8BTU1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cfap20Q8BTU1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cfap20Q8BTU1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cfap20Q8BTU1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cfap20Q8BTU1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cfap20Q8BTU1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cfap20Q8BTU1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cfap20Q8BTU1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cfap20Q8BTU1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cfap20Q8BTU1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cfap20Q8BTU1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cfap20Q8BTU1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cfap20Q8BTU1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cfap20Q8BTU1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cfap20Q8BTU1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms