Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS3

Gbp9, Guanylate-binding protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp9Q8BTS3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gbp9Q8BTS3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gbp9Q8BTS3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gbp9Q8BTS3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gbp9Q8BTS3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Gbp9Q8BTS3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gbp9Q8BTS3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gbp9Q8BTS3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gbp9Q8BTS3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Gbp9Q8BTS3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gbp9Q8BTS3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gbp9Q8BTS3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gbp9Q8BTS3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gbp9Q8BTS3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Gbp9Q8BTS3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gbp9Q8BTS3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gbp9Q8BTS3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gbp9Q8BTS3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gbp9Q8BTS3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gbp9Q8BTS3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gbp9Q8BTS3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gbp9Q8BTS3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gbp9Q8BTS3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gbp9Q8BTS3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gbp9Q8BTS3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gbp9Q8BTS3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gbp9Q8BTS3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gbp9Q8BTS3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gbp9Q8BTS3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gbp9Q8BTS3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gbp9Q8BTS3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gbp9Q8BTS3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gbp9Q8BTS3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gbp9Q8BTS3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Gbp9Q8BTS3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gbp9Q8BTS3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gbp9Q8BTS3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gbp9Q8BTS3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gbp9Q8BTS3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gbp9Q8BTS3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gbp9Q8BTS3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gbp9Q8BTS3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gbp9Q8BTS3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gbp9Q8BTS3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gbp9Q8BTS3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gbp9Q8BTS3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gbp9Q8BTS3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gbp9Q8BTS3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gbp9Q8BTS3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gbp9Q8BTS3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gbp9Q8BTS3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gbp9Q8BTS3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gbp9Q8BTS3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gbp9Q8BTS3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gbp9Q8BTS3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gbp9Q8BTS3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gbp9Q8BTS3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gbp9Q8BTS3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gbp9Q8BTS3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gbp9Q8BTS3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gbp9Q8BTS3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gbp9Q8BTS3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gbp9Q8BTS3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gbp9Q8BTS3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gbp9Q8BTS3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gbp9Q8BTS3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gbp9Q8BTS3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gbp9Q8BTS3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gbp9Q8BTS3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gbp9Q8BTS3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gbp9Q8BTS3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gbp9Q8BTS3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gbp9Q8BTS3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gbp9Q8BTS3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gbp9Q8BTS3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gbp9Q8BTS3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gbp9Q8BTS3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gbp9Q8BTS3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gbp9Q8BTS3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gbp9Q8BTS3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gbp9Q8BTS3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gbp9Q8BTS3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gbp9Q8BTS3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gbp9Q8BTS3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gbp9Q8BTS3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gbp9Q8BTS3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gbp9Q8BTS3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gbp9Q8BTS3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gbp9Q8BTS3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gbp9Q8BTS3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gbp9Q8BTS3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gbp9Q8BTS3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gbp9Q8BTS3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gbp9Q8BTS3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gbp9Q8BTS3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gbp9Q8BTS3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gbp9Q8BTS3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gbp9Q8BTS3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gbp9Q8BTS3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gbp9Q8BTS3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms