Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSF5

Klhl38, Kelch-like protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl38Q8BSF5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Klhl38Q8BSF5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Klhl38Q8BSF5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Klhl38Q8BSF5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Klhl38Q8BSF5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Klhl38Q8BSF5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Klhl38Q8BSF5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Klhl38Q8BSF5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Klhl38Q8BSF5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Klhl38Q8BSF5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Klhl38Q8BSF5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Klhl38Q8BSF5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Klhl38Q8BSF5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Klhl38Q8BSF5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Klhl38Q8BSF5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Klhl38Q8BSF5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Klhl38Q8BSF5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Klhl38Q8BSF5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Klhl38Q8BSF5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Klhl38Q8BSF5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Klhl38Q8BSF5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Klhl38Q8BSF5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Klhl38Q8BSF5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Klhl38Q8BSF5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Klhl38Q8BSF5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Klhl38Q8BSF5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Klhl38Q8BSF5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Klhl38Q8BSF5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Klhl38Q8BSF5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Klhl38Q8BSF5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Klhl38Q8BSF5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Klhl38Q8BSF5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Klhl38Q8BSF5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Klhl38Q8BSF5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Klhl38Q8BSF5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Klhl38Q8BSF5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Klhl38Q8BSF5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Klhl38Q8BSF5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Klhl38Q8BSF5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Klhl38Q8BSF5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Klhl38Q8BSF5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Klhl38Q8BSF5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Klhl38Q8BSF5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Klhl38Q8BSF5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Klhl38Q8BSF5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Klhl38Q8BSF5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Klhl38Q8BSF5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Klhl38Q8BSF5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Klhl38Q8BSF5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Klhl38Q8BSF5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Klhl38Q8BSF5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Klhl38Q8BSF5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Klhl38Q8BSF5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Klhl38Q8BSF5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Klhl38Q8BSF5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Klhl38Q8BSF5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Klhl38Q8BSF5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Klhl38Q8BSF5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Klhl38Q8BSF5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Klhl38Q8BSF5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Klhl38Q8BSF5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Klhl38Q8BSF5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Klhl38Q8BSF5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Klhl38Q8BSF5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Klhl38Q8BSF5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Klhl38Q8BSF5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Klhl38Q8BSF5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Klhl38Q8BSF5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Klhl38Q8BSF5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Klhl38Q8BSF5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Klhl38Q8BSF5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Klhl38Q8BSF5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Klhl38Q8BSF5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Klhl38Q8BSF5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Klhl38Q8BSF5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Klhl38Q8BSF5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Klhl38Q8BSF5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Klhl38Q8BSF5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Klhl38Q8BSF5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Klhl38Q8BSF5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Klhl38Q8BSF5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Klhl38Q8BSF5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Klhl38Q8BSF5 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Klhl38Q8BSF5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Klhl38Q8BSF5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Klhl38Q8BSF5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Klhl38Q8BSF5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Klhl38Q8BSF5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Klhl38Q8BSF5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Klhl38Q8BSF5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Klhl38Q8BSF5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Klhl38Q8BSF5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Klhl38Q8BSF5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Klhl38Q8BSF5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Klhl38Q8BSF5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Klhl38Q8BSF5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Klhl38Q8BSF5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Klhl38Q8BSF5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Klhl38Q8BSF5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Klhl38Q8BSF5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms