Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQN9

C030005K15Rik, RIKEN cDNA C030005K15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C030005K15RikQ8BQN9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
C030005K15RikQ8BQN9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
C030005K15RikQ8BQN9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C030005K15RikQ8BQN9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
C030005K15RikQ8BQN9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C030005K15RikQ8BQN9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
C030005K15RikQ8BQN9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C030005K15RikQ8BQN9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
C030005K15RikQ8BQN9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C030005K15RikQ8BQN9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C030005K15RikQ8BQN9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C030005K15RikQ8BQN9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
C030005K15RikQ8BQN9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C030005K15RikQ8BQN9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C030005K15RikQ8BQN9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C030005K15RikQ8BQN9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C030005K15RikQ8BQN9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C030005K15RikQ8BQN9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
C030005K15RikQ8BQN9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
C030005K15RikQ8BQN9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
C030005K15RikQ8BQN9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C030005K15RikQ8BQN9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C030005K15RikQ8BQN9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C030005K15RikQ8BQN9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C030005K15RikQ8BQN9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C030005K15RikQ8BQN9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C030005K15RikQ8BQN9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
C030005K15RikQ8BQN9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C030005K15RikQ8BQN9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C030005K15RikQ8BQN9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C030005K15RikQ8BQN9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C030005K15RikQ8BQN9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C030005K15RikQ8BQN9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C030005K15RikQ8BQN9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C030005K15RikQ8BQN9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C030005K15RikQ8BQN9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C030005K15RikQ8BQN9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C030005K15RikQ8BQN9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C030005K15RikQ8BQN9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C030005K15RikQ8BQN9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
C030005K15RikQ8BQN9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
C030005K15RikQ8BQN9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C030005K15RikQ8BQN9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
C030005K15RikQ8BQN9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
C030005K15RikQ8BQN9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
C030005K15RikQ8BQN9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
C030005K15RikQ8BQN9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
C030005K15RikQ8BQN9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
C030005K15RikQ8BQN9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
C030005K15RikQ8BQN9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
C030005K15RikQ8BQN9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
C030005K15RikQ8BQN9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
C030005K15RikQ8BQN9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
C030005K15RikQ8BQN9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
C030005K15RikQ8BQN9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
C030005K15RikQ8BQN9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
C030005K15RikQ8BQN9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
C030005K15RikQ8BQN9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
C030005K15RikQ8BQN9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
C030005K15RikQ8BQN9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
C030005K15RikQ8BQN9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
C030005K15RikQ8BQN9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
C030005K15RikQ8BQN9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
C030005K15RikQ8BQN9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C030005K15RikQ8BQN9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C030005K15RikQ8BQN9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
C030005K15RikQ8BQN9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
C030005K15RikQ8BQN9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C030005K15RikQ8BQN9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
C030005K15RikQ8BQN9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C030005K15RikQ8BQN9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C030005K15RikQ8BQN9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C030005K15RikQ8BQN9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C030005K15RikQ8BQN9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
C030005K15RikQ8BQN9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C030005K15RikQ8BQN9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C030005K15RikQ8BQN9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C030005K15RikQ8BQN9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C030005K15RikQ8BQN9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C030005K15RikQ8BQN9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C030005K15RikQ8BQN9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C030005K15RikQ8BQN9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C030005K15RikQ8BQN9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C030005K15RikQ8BQN9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
C030005K15RikQ8BQN9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C030005K15RikQ8BQN9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C030005K15RikQ8BQN9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C030005K15RikQ8BQN9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C030005K15RikQ8BQN9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C030005K15RikQ8BQN9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
C030005K15RikQ8BQN9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
C030005K15RikQ8BQN9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C030005K15RikQ8BQN9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C030005K15RikQ8BQN9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C030005K15RikQ8BQN9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C030005K15RikQ8BQN9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C030005K15RikQ8BQN9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C030005K15RikQ8BQN9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C030005K15RikQ8BQN9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C030005K15RikQ8BQN9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1136.8 ms