Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLY1

Smoc1, SPARC-related modular calcium-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smoc1Q8BLY1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smoc1Q8BLY1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smoc1Q8BLY1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smoc1Q8BLY1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smoc1Q8BLY1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smoc1Q8BLY1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smoc1Q8BLY1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smoc1Q8BLY1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Smoc1Q8BLY1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smoc1Q8BLY1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smoc1Q8BLY1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smoc1Q8BLY1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smoc1Q8BLY1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Smoc1Q8BLY1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smoc1Q8BLY1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smoc1Q8BLY1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smoc1Q8BLY1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smoc1Q8BLY1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Smoc1Q8BLY1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smoc1Q8BLY1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smoc1Q8BLY1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smoc1Q8BLY1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Smoc1Q8BLY1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smoc1Q8BLY1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smoc1Q8BLY1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smoc1Q8BLY1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smoc1Q8BLY1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smoc1Q8BLY1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Smoc1Q8BLY1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smoc1Q8BLY1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smoc1Q8BLY1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Smoc1Q8BLY1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smoc1Q8BLY1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smoc1Q8BLY1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smoc1Q8BLY1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smoc1Q8BLY1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smoc1Q8BLY1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smoc1Q8BLY1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smoc1Q8BLY1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smoc1Q8BLY1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smoc1Q8BLY1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smoc1Q8BLY1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smoc1Q8BLY1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smoc1Q8BLY1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smoc1Q8BLY1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smoc1Q8BLY1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smoc1Q8BLY1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smoc1Q8BLY1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smoc1Q8BLY1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smoc1Q8BLY1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smoc1Q8BLY1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smoc1Q8BLY1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smoc1Q8BLY1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smoc1Q8BLY1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smoc1Q8BLY1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smoc1Q8BLY1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smoc1Q8BLY1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smoc1Q8BLY1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smoc1Q8BLY1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smoc1Q8BLY1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smoc1Q8BLY1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smoc1Q8BLY1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smoc1Q8BLY1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smoc1Q8BLY1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Smoc1Q8BLY1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smoc1Q8BLY1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smoc1Q8BLY1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Smoc1Q8BLY1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smoc1Q8BLY1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smoc1Q8BLY1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smoc1Q8BLY1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Smoc1Q8BLY1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smoc1Q8BLY1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smoc1Q8BLY1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Smoc1Q8BLY1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smoc1Q8BLY1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smoc1Q8BLY1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smoc1Q8BLY1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smoc1Q8BLY1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smoc1Q8BLY1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Smoc1Q8BLY1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Smoc1Q8BLY1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smoc1Q8BLY1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Smoc1Q8BLY1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Smoc1Q8BLY1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Smoc1Q8BLY1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smoc1Q8BLY1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Smoc1Q8BLY1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smoc1Q8BLY1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smoc1Q8BLY1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smoc1Q8BLY1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smoc1Q8BLY1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Smoc1Q8BLY1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smoc1Q8BLY1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smoc1Q8BLY1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smoc1Q8BLY1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smoc1Q8BLY1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smoc1Q8BLY1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smoc1Q8BLY1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Smoc1Q8BLY1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.2 ms